1、R语言手动绘制 安装加载所需R包 install.packages('VennDiagram') library(VennDiagram)
setwd('d:/venn') venn1<- venn.diagram(list(a="1:150," b="121:170),'venn1') ">->
同理可画出更多集合的韦恩图,通常情况下最多绘制五个集合的韦恩图 venn2<- venn.diagram(list(a="1:150," b="121:170,C=75:234,D=23:190),filename=NULL) ">-> grid.draw(venn2) ##图片显示在屏幕上
美化: venn3<- venn.diagram(list(a="1:150," b="121:170,C=75:234,D=23:190),'venn3.png', " col='black' ,fill="c('cornflowerblue'," 'green',="" 'yellow',="" 'darkorchid1'),alpha="0.4,cat.col" =="" c('darkblue',="" 'darkgreen',="" 'orange',="" 'darkorchid4'),="" cat.cex="1.5,rotation.degree" =="">->
参数: filename:指定用于保存图形文件的文件名,如果希望在当前的图形窗口中看到绘制的韦恩图,则filename必须为空; 若希望将绘制的图形直接保存为某文件,则直接使用venn.diagram(...,filename='*')即可完成。 col表示对应的圆周的颜色 fill:表示各个集合对应的圆的填充颜色 alpha:透明度 cat.col:表示集合名称的显示颜色 lwd:用于设定圆弧的宽度 lty:用于设定圆弧的线型 rotation.degree:可用于调整图形的旋转角度
2、利用在线工具绘制
摘要 基因组研究过程中,基因家族聚类分析是一个比较重要的内容。基因家族聚类过程中通常会用venn图来展示聚类的情况。 R语言或者其他的画图语言都可以本地实现venn图的绘制,但是有一个venn图的在线绘制工具,大家知道吗? 操作步骤 网址:http://bioinformatics.psb./webtools/Venn/ 下面我就简单的介绍下这个在线绘制venn图的工具,希望能在科研工作中助你一臂之力。 打开界面:
软件界面优化,目前只能绘制5个及以下的venn图,超过5个的不会绘制图片,但是也会进行分析。
提供两种数据输入方式,第一种是导入list文件,第二种是直接由键盘输入。我演示一下键盘输入:
点击提交 得到的结果如下
Venn图提供两种作图的方法,另一种格式如下:
你可以将图片保存下来。
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