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1. DIANA-LncBase v2 网址链接：http://www./LncBase。该数据库前段时间小编分享过了，该数据库有预测模块和实验验证模块进行lncRNA-miRNA结合可能性预测，实验验证模块基于150个CLIP-Seq数据。  2. LNCediting 网址链接：http://bioinfo.life./LNCediting/。该数据库提供了lncRNA的RNA编辑数据，可分析二级结构的变化，预测lncRNA和miRNA的结合可能性。数据库物种包括人，恒河猴，小鼠和果蝇。  3. NPInter v3.0 网址链接：http://www./NPInter/。该数据库由中科国学院生物物理所开发，包含了72万多个RNA-RNA结合数据，其中就包含lncRNA-miRNA结合预测。  4. lncReg 网址链接：http://bioinformatics.ustc.edu.cn/lncreg/。该数据库对lncRNA和miRNA的结合信息预测是基于259个研究结果整理。因此，该数据库得到的lncRNA-miRNA，相比还是可靠性比较高的。友情提醒：该网站目前没法直接检索，但是可以在“download”下进行下载。  5. LNCipedia v4.0 网址链接：http://www.。该数据库最近更新数据后也有14多万个lncRNA数据信息，除了提供序列，编码潜能预测，二级结构和保守性分析外，也能够预测可能的lncRNA-miRNA结合关系。  6. lncRNASNP 网址链接：http://bioinfo.life./lncRNASNP/。该数据库除了能预测lncRNA上的SNP位点对其二级结构的影响外，还可以提供lncRNA-miRNA结合预测。  7. starBase v2.0 网址链接：http://starbase./。该数据库由中山大学开发，集合了108个CLIP-Seq数据，可对lncRNA-miRNA结合可能性进行预测。  8. LncRNAMAP 网址链接：http://lncRNAMap.mbc./。该数据库基于高通量测序数据，对lncRNA的调控功能进行预测，可预测lncRNA-miRNA结合。  以上就是到目前为止，可能进行lncRNA-miRNA结合预测的数据库。八大数据库，你是否会嫌多？相信很多小伙伴的答案是否定的。至于怎么用呢？一个个用可以，结合起来用也可以，技多不压身，收藏为上策。 参考文献： Yamamura, S., M. Imai-Sumida, Y. Tanaka and R. Dahiya (2017). 'Interaction and cross-talk between non-coding RNAs.' Cell Mol Life Sci. 【温馨提示】本文为微信号：基因芯片知识屋（bio-microarry）原创文章，如需转载请注明来源：基因芯片知识屋。 |
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