[转载]常用的lncRNA数据库

以下是整理的长链非编码RNA(lncRNA, lincRNA)数据库资源列表。
国内外长非编码RNA的研究刚刚兴起，希望这资源对国内的非编码RNA的研究者有所帮助。
（1）lncRNABase: 提供miRNA调控长非编码RNA(lncRNA)、假基因(pseudogene)和环状RNA(circRNA)的互作信息和ceRNA调控网络。构建了最全面的包含了14癌症类型（>6000个样本）Pan-Cancer（泛癌）表达图谱和互作网络。这些调控互作网络信息是基于高通量的CLIP-Seq实验数据。网站：http://starbase./mirLncRNA.php 更新： 2013年11月
（2）LNCipedia: 对人类的长链非编码RNA的序列和结构全面的注释。网站：http://www. 更新：2012年7月
（3） ChIPBase: 提供长链非编码RNA的表达图谱和转录调控的全面鉴定和注释。整合了高通量的RNA-seq鉴定的lncRNA及其表达图谱和ChIP-Seq实验技术鉴定的转录因子结合位点。网站：http://deepbase./chipbase/ 更新：2012年11月
（4）lncRNAdb: 提供有生物学功能的长链非编码RNA的全面注释。这是长链非编码RNA研究领域的大牛John mattick实验室构建的网站。网站：http://www./ 更新：2011年7月

（5）LncRNADisease: 提供了文献报道的疾病相关的长链非编码RNA的注释。 网站： http://cmbi./lncrnadisease 更新：2012年7月

（6）NONCODE：提供对长链非编码RNA的全面注释，包括表达和该团队开发的ncFANs计算机软件预测的lncRNA功能。这是非编码RNA研究的知名数据库，已经更新到第三版。网站： http://www. 更新：2012年1月

（7）NRED： 提供人和小鼠的长链非编码RNA在芯片数据的表达信息。这也是John mattick实验室构建的网站。网站：http://jsm-research.imb./nred/ 更新： 2009年