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今天小编给大家带来的是有关miRNA的一些最近研究进展，请各位老师往下看！ A viral Sm-class RNA base-pairs with mRNAs and recruits microRNAs to inhibit apoptosis Nature 2017-10-4 IF：40.137 病毒可表达几类非编码RNA；但大多数这些行为的功能和机制是未知的。松鼠猴疱疹病毒（Herpesvirus saimiri）是一种γ-疱疹病毒，可在新世界灵长类动物T细胞中建立潜伏期并且具有在非天然宿主中引起侵袭性白血病和淋巴瘤的能力，在潜伏感染的细胞中可表达7种小核尿嘧啶富集的非编码RNAs（称为HSUR）。这些HSURs与Sm蛋白结合，并与细胞Sm-类小核RNAs共享生物发生和结构特征。其中一种HSURs(HSUR2)与两个宿主细胞microRNAs(miR-142-3p和miR-16)碱基配对，但不影响其丰度或活性，这表明其与它们的相互作用可以发挥替代作用。本研究显示HSUR2也与感染细胞中的mRNA进行碱基配对。作者结合体内补骨脂素介导的RNA-RNA交联和高通量测序来鉴定HSUR2靶向的mRNA，其包括编码成视网膜细胞瘤的mRNA和参与p53信号转导和凋亡的因子。研究显示HSUR2抑制靶mRNA的表达，并且HSUR2与miR-142-3p和miR-16之间的碱基配对对于这种抑制是必需的，这表明HSUR2将这两种细胞microRNAs募集到其靶mRNA。此外，HSUR2使用这种机制抑制细胞凋亡。研究结果揭示了这种病毒Sm-类RNA作为microRNA适配器在前体mRNA加工后的基因表达调控中的作用。 原文：Gorbea C, Mosbruger T, Cazalla D. A viral Sm-class RNA base-pairs with mRNAs and recruits microRNAs to inhibit apoptosis[J]. Nature, 2017. A Chiral-Nanoassemblies-Enabled Strategy for Simultaneously Profiling Surface Glycoprotein and MicroRNA in Living Cells Adv Mater 2017-10-5 IF：19.791 用于活细胞生物应用的纳米材料组件已经引起了广泛的关注。本文中，氧化石墨烯（GO）-金纳米颗粒（Au NP）组件由夹板DNA链驱动，夹板DNA链两端设计有两个区域，与锚定在GO和Au NPs表面上的DNA序列互补。在microRNA（miR）-21和上皮细胞粘附分子（EpCAM）存在的情况下，miR-21与分子探针的杂交导致6-荧光素-亚磷酰胺修饰的Au NPs从GO分离出来，导致拉曼（Raman）信号降低，而EpCAM的识别降低了圆二色性（CD）信号。当与两个对映体几何形状相关的细胞反应时，CD信号从原始组件中的阴性反转为阳性。EpCAM检测线性范围为8.47-74.78 pg mL-1，检出限（LOD）为3.63 pg mL-1，而miR-21检测显示了一个显著的线性范围0.07-13.68 amol ng-1RNA，LOD为0.03 amol ng-1RNA。所有结果与拉曼和共焦生物成像的结果非常一致。 该策略开辟了一条途经，可以高度准确和可靠地诊断（双重目标）临床疾病。  Fig. GO–Au assemblies strategy for epithelial cell adhesion molecule (EpCAM, probe Ep) and miR-21 detection (probe mR). A) The fabrication routes for probe Ep and probe mR (FAM used as Raman tag), respectively. B) The probe Ep and probe mR used for dual detection of two types of targets in which the probe Ep is used for detection of EpCAM by the CD signal. C) The probe mR is used for detection of miR-21 by the Raman signal. 原文：Ma W, Sun M, Fu P, et al. A Chiral‐Nanoassemblies‐Enabled Strategy for Simultaneously Profiling Surface Glycoprotein and MicroRNA in Living Cells[J]. Advanced Materials, 2017. Immune Modulatory microRNAs Involved in Tumor Attack and Tumor Immune Escape J Natl Cancer Inst 2017-10-1 IF：12.589 目前可利用癌症患者的免疫系统进行肿瘤根除治疗。然而，肿瘤细胞可以通过各种策略逃避CD8+ T和自然杀伤（NK）细胞的免疫监视。包括人类白细胞抗原（HLA）Ⅰ类抗原，共抑制或共刺激分子，以及干扰素（IFN）信号转导途径组分的异常表达。此外，肿瘤微环境的改变可以通过下调或抑制免疫效应细胞和专职抗原呈递细胞的频率和功能活性来干扰有效的抗肿瘤免疫反应最近，microRNA（miRNA）已经被确定为基因表达转录后调控的主要参与者，从而控制许多生理学和病理生理过程，包括肿瘤转化。事实上，细胞miRNA表达模式在许多不同来源的肿瘤中经常发生改变，表明miRNA的肿瘤抑制或致癌潜力。此外，越来越多的证据表明，miRNA也可以通过影响肿瘤和免疫细胞中免疫调节分子的表达来影响抗肿瘤免疫应答。除了它们在肿瘤免疫逃逸和改变肿瘤-宿主相互作用中的重要作用外，免疫调节性miRNA通常发挥肿瘤特性，从而为未来联合免疫治疗方法提供了有希望的靶点。本文的重点是关于调节免疫监视或肿瘤免疫逃逸的miRNAs的特征及其作为诊断和预后生物标志物或作为治疗靶点的潜在用途。 原文：Eichmüller S B, Osen W, Mandelboim O, et al. Immune Modulatory microRNAs Involved in Tumor Attack and Tumor Immune Escape[J]. JNCI: Journal of the National Cancer Institute, 2017: djx034. Frequent miRNA-convergent fusion gene events in breast cancer Nat Commun 2017-10-5 IF：12.124 融合基因的研究主要集中在产生杂交蛋白的融合的形成，或者是在启动子“开关”事件中，使基因处于异常信号的控制之下。然而，基因融合也可能破坏在断点下游内含子中编码的基因转录调控。通过忽略转录融合的结构限制，作者强调了融合基因大部分未被发现的功能的重要性。本文中，作者以乳腺癌为例，miRNA宿主基因在融合基因中特别丰富，许多不同的低频5' 伴侣基因可以解除对相同miRNA的调节，而不考虑融合转录本的编码潜力如何。这些结果表明，递归的概念需要修改，以涵盖影响miRNA的收敛融合，其不依赖于转录结构和蛋白质编码潜能。融合基因的研究传统上集中于导致杂交蛋白或启动子“开关”事件的融合。本文中，作者证实了乳腺癌miRNA宿主基因融合的富集，强调不同的融合可能对miRNA具有收敛的影响。 原文：Persson H, Søkilde R, Häkkinen J, et al. Frequent miRNA-convergent fusion gene events in breast cancer[J]. Nature Communications, 2017, 8(1): 788. Mammalian APE1 controls miRNA processing and its interactome is linked to cancer RNA metabolism Nat Commun 2017-10-6 IF：12.124 哺乳动物脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1是一种DNA修复酶，参与基因组稳定性以及参与氧化应激反应，肿瘤进展和化学耐药性的基因的表达。然而，在这些过程中，脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1作用的分子机制仍不清楚。最近的研究结果表明了脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1在RNA代谢中的新作用。通过表征脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1与RNA和其他蛋白质的相互作用，作者在本文中通过在基因毒性应激过程中与DROSHA加工复合物的联合，证明了脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1在pri-miRNA加工和稳定性中的作用。研究还显示，在调节肿瘤抑制基因PTEN表达过程中，miR-221/222的加工需要脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1的核酸内切酶活性。作者还发现脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1参与了涉及癌症发生的RNA相互作用组和蛋白质相互作用组，从而表明对癌症基因的转录后效应不明确。APE1在细胞对氧化应激的反应中起着重要的作用，而突变则与肿瘤的进展和化学抗性有关。本文中，作者描述了APE1与RNA的相互作用，并证明了在microRNA加工中的作用。 原文：Antoniali G, Serra F, Lirussi L, et al. Mammalian APE1 controls miRNA processing and its interactome is linked to cancer RNA metabolism[J]. Nature Communications, 2017, 8(1): 797. EGF hijacks miR-198/FSTL1 wound-healing switch and steers a two-pronged pathway toward metastasis J Exp Med 2017-10-2 IF：11.991 众所周知，上皮癌会激活一种促进恶性转化的延长伤口愈合的程序。伤口闭合需要通过双态分子开关激活角化细胞迁移。该开关涉及从单个转录物中产生抗迁移microRNA miR-198或前体迁移性卵泡抑素样1（FSTL1）蛋白；健康皮肤中miR-198的表达下调，有利于FSTL1产生，增强角质形成细胞迁移并促进再上皮化。本研究中，作者揭示了头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中有缺陷的分子开关。这种缺陷关闭了miR-198表达，有利于持续的FSTL1翻译，通过涉及DIAPH1和FSTL1的双重并行途径驱动癌细胞的转移。DIAPH1是一种miR-198的靶标，通过Arpin（Arp2/3复合物的竞争性抑制剂）的螯合增强了定向迁移。FSTL1阻断Wnt7a介导的细胞外信号调节激酶磷酸化的抑制，使得能够产生MMP9，其降解细胞外基质并促进转移。FSTL1-DIAPH1基因对的预后意义使其成为治疗干预的强有力靶标。 原文：Sundaram G M, Ismail H M, Bashir M, et al. EGF hijacks miR-198/FSTL1 wound-healing switch and steers a two-pronged pathway toward metastasis[J]. Journal of Experimental Medicine, 2017, 214(10): 2889-2900. Endogenous miRNA in the green alga Chlamydomonas regulates gene expression through CDS-targeting Nat Plants 2017-10-2 IF：10.3 MicroRNAs（miRNA）是存在于许多真核生物中的21-24个核苷酸的RNA，其调节基因表达，作为RNA诱导的沉默复合物的一部分。miRNA的序列同一性提供了一种可以通过碱基配对过程来引导沉默效应物Argonaute (AGO)蛋白靶向mRNA的特异性。AGO复合物促进该靶mRNA的翻译抑制和加速衰减。在体内和体外都有大量的证据表明，翻译抑制扮演着重要的角色。然而，关于这三种机制中哪一种更重要存在争议，特别是当miRNA对内源性基因的影响不能忠实地由报告系统来表示的时候，至少在后生动物中，观察到的抑制远远超过了通常观察到的内源性mRNAs。本文中，作者对进化久远的单细胞绿藻莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii）进行了全面综合分析来量化miRNA对蛋白质合成和RNA丰度的影响。研究显示，类似于后生动物稳态系统，衣藻中的内源性miRNA可以通过mRNA的不稳定和通过翻译抑制来调节基因表达。然而，后生动物miRNA的靶位点使用主要定位于3'UTR，不同的是，在Chlamydomonas中，靶位点的使用主要位于编码区内。这些结果证明了miRNA的进化保守作用模式，但在植物和后生动物王国之间存在着机制的差异。MicroRNAs调控基因表达，作为RNA诱导的沉默复合物的一部分。莱茵衣藻中miRNA的分析表明，藻类miRNA主要位于编码区内，以破坏mRNA的稳定和抑制翻译。 原文：Chung B Y, Deery M J, Groen A J, et al. Endogenous miRNA in the green alga Chlamydomonas regulates gene expression through CDS-targeting[J]. Nature plants, 2017.  |
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