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这个研究方向的国自然资助项目数,居然比去年翻了6倍

 微笑如酒 2017-11-03

2012年,Dixon等人在研究小分子化合物Erastin处理RAS突变的肿瘤细胞,发现了一个现象,并报道了一类新型的由铁依赖性的氧化损伤引起的细胞死亡模式,并命名为Ferroptosis(铁死亡)。


细胞铁死亡与多种疾病的发生发展密切相关,如亨庭顿氏疾病、阿尔兹海默、帕金森等退行性疾病有关,与肿瘤的发生、脑卒中、颅内出血、脑外伤、缺血再灌注损伤、肾病变性以及植物热应激等同样有关。另外铁死亡也具有肿瘤抑制功能,这一点可以运用到肿瘤治疗方面

铁死亡受细胞内信号通路的严密调节,这些信号通路包括铁稳态的调节通路、RAS通路以胱氨酸转运通路。


铁死亡这一细胞死亡过程与凋亡、坏死和自噬在形态学特征及生理生化方面均有差异。

  • 铁死亡典型的特征表现为细胞质以及脂质活性氧自由基增多线粒体变小,而线粒体的双层膜密度增加

  • 凋亡典型的特征包括细胞皱缩、核浓缩、染色质边集、DNA片段化、膜起泡、核和胞浆断裂成凋亡小体,后被邻近的细胞吞噬和降解

  • 坏死的形态学特征是细胞和细胞器肿胀、膜破裂、核染色体溶解而不是固缩,线粒体受损,随后细胞溶解

  • 自噬典型的特征为细胞内出现大量泡状结构,即双层膜结构的自吞噬泡,吞噬泡内为胞质及细胞器.高尔基器、核糖体、内质网等均先于核的改变而被降解,但细胞骨架成分却大部分保存。




细胞铁死亡从开始报道至今也才五年时间,算是非常新星的领域,但是相比于之前梦熊介绍细胞焦亡、坏死性凋亡,铁死亡的国自然基金在今年实现了一个飞跃,从2016年的3项迅速增加到18项。


基金案列
MicroRNA-30e通过铁死亡途径调控乳腺癌放射敏感性的作用及其分子机制研究
新长链非编码RNA  LncRNA-RP4HA通过CAPRIN2/HMGCS1调控鼻咽癌转移与铁死亡
PAK4特异性介导的铁死亡在非小细胞肺癌对Gefitinib耐药过程的作用及机制研究
双氢青蒿素通过上调铁结合蛋白自噬性降解诱导膀胱癌细胞铁死亡(ferroptosis)机制的研究
HMGB1调控急性髓系白血病细胞铁死亡的分子机制
GPX4去乙酰化诱导铁死亡增加肿瘤细胞辐射损伤的机制研究

这里我们可以看到,无论是我们熟悉miRNA、lncRNA、蛋白,还是中药、蛋白修饰在调控细胞铁死亡中均能涉及到。




我们来看一篇文章。

Activation of the p62-Keap1-NRF2 pathway protects against ferroptosis in hepatocellular carcinoma cells.Hepatology

文章讲的是在肝癌中,NRF2能够抑制Erastin和Sorafenib诱导的肝癌细胞的铁死亡,从而降低药物对肝癌的治疗效果。


之所以选中NRF2,是因为NRF2在氧化应激反应中有着重要作用(文献报道),同时还是一个转录因子(做机制就很方便了)。


先看NRF2的下游机制。考虑到铁死亡是一个与铁离子以及活性氧密切相关的细胞死亡过程,作者敲减NRF2后,观察下游铁代谢和亚铁血红素相关的基因表达量变化,筛选出NQO1、HO1和FTH1。这三者均是抗氧化剂,敲减这些基因会促进使铁死亡。NRF2与下游三个基因的具体机制是怎样的呢?毕竟转录因子,转录调控咯!NRF2通过与MafG(也是转录因子)的相互作用(文献报道),激活下游NQO1、HO1和FTH1的转录。


再看上游机制。在之前的研究中有报道:p62能够通过失活Keap1来激活NRF2。作者这里直接套用了这一机制,实验条件换成了Erastin和Sorafenib处理。



以上大抵上就是一个国自然面上项目的思路了:

1、确定一个机制——铁死亡;

2、选择一个核心基因——NRF2(转录因子);

3、设计上下游机制——文献报道结合转录调控等机制套路;

4、预实验——填补机制图中的空缺,一般可以通过表达相关性的验证来筛选目的基因,后续再通过实验验证它们与核心基因的作用机制。


Ref:

1 铁死亡:一种新的细胞死亡方式.Progress in Biochemistry and Biophysics

2 Ferroptosis: An Iron-Dependent Form of Non-Apoptotic Cell Death.CELL

3 THE PANTHEON OF THE FALLEN:WHY ARE THERE SO MANY FORMS OF CELL DEATH?Trends Cell Biol.

4 Ferroptosis: A Regulated Cell Death Nexus Linking Metabolism, Redox Biology, and Disease.CELL

5 Activation of the p62-Keap1-NRF2 pathway protects against ferroptosis in hepatocellular carcinoma cells.Hepatology

6 Role of nrf2 in oxidative stress and toxicity.Annu Rev Pharmacol Toxicol.

7 An Nrf2/small Maf heterodimer mediates the induction of phase II detoxifying enzyme genes through antioxidant response elements.BBRC

8 The selective autophagy substrate p62 activates the stress responsive transcription factor Nrf2 through inactivation of Keap1.Nat Cell Biol


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