高通量测序这种高大上的东西,其实已经是站在了潮流的前列线了(下面是RNA-Seq蚊帐的发表量)。 做个二代测序,不分析点什么剪接异构,RNA突变,估计都对不起烧掉的那些钱。但是为了防止你们被忽悠,首先要弄清楚的,到底有哪几种测序,你要用的是啥? 前几天,小林子屁颠屁颠地跑来,说一个测序公司说可以给他做外显子捕获测序,测表达,还能测基因突变,这货估计是要被忽悠进去了。 不要听着外显子捕获测序,虽说是有外显子,但其实这是一种基因组Genomic DNA的测序,主要就是把基因组的外显子序列给收集起来,然后进行高通量测序。分析基因的突变以及SNP,是根本不能检测基因表达的。 检测基因表达的二代测序也有两种,一种是表达谱测序(RNA Seq Qualification,也有叫DGE的,Digital Gene Expression Profiling),另一种就是转录组测序(RNA Seq Transcriptome)。 表达谱测序,之关注表达,就是通过酶切,把RNA反转出来的cDNA切成小片段,建库,进行测序,然后把测序的结果和参比序列进行比对,看各个小标签的表达量: 而,转录本测序,则是把整个RNA(去掉rRNA),然后进行测序,获得的结果要比表达谱测序多出很多。比如RNA各个转录本的剪接异构、SNP都能在这里体现出来: 转录组测序和表达谱测序的结果,比较起来的话,大概就是这样: 哪个更贵,或者获得的数据更多,自己心里应该有数了吧。 蓝儿,转录组测序的分析就比较复杂,想要挖出一些有价值的数据的话,就比较难了。这就需要使用R语言来进行深入的分析了! 老板、主任紧随时代潮流,做了测序,让你分析,你却不知道该怎么回答? 没关系,这些都不用担心,我们的《RNA-seq数据分析详解》上线啦! 从事医学、生命科学等领域的临床工作者、老师和学生等;有RNA-seq或者生物信息学分析需求的
1、国内一流院校生物信息学老师讲解 2、理论加实践:理论讲解测序原理、应用等知识,实践手把手教你如何分析RNA-seq数据 3、针对RNA-seq核心分析,精品制作,完整的课题和论文发表思路 4、从软件的介绍到具体如何安装、使用以及对分析结果解读,都有详细的讲解,步步到位 掌握RNA-seq理论知识和核心分析方法。学生学完开辟新的职业发展大马路,医生学完开辟SCI发表新路线,从此成为科室的小红人,老板、主任宠着你 高通量测序原理、测序价格和通量以及实际应用等;测序数据分析常用文件格式介绍,包括FASTQ/FASTA、SAM/BAM、GTF等;转录组测序RNA-seq概念、原理、用途等;RNA-seq和芯片的区别和优势以及RNA-seq数据最佳分析流程;生物信息学分析Linux和R语言操作基础:RNA-seq质控、序列比对、基因定量分析方法;如何对RNA-seq数据做差异表达基因分析;基因功能、信号通路富集及网络互作等下游分析。
《RNA-seq数据分析详解》 第一节:高通量测序技术及其在生命医学中的应用 第二节:NGS常用文件格式详解 第三节:转录组测序RNA-seq及其分析流程 第四节:Linux操作基础 第五节:R语言基础操作 第六节:NGS数据质量控制方法 第七节:RNA-seq序列比对 第八节:RNA-seq基因定量分析方法 第九节:RNA-seq差异表达基因分析 第十节:基因功能和信号通路富集分析 第十一节:基因互作数据库 第十二节:基因网络图制作介绍 第十三节:基因网络图制作实操s 第十四节:课后练习题1 第十五节:课后练习题2 第十六节:课后练习题3 价格:599元,促销价399(促销时间2017.12.24-26)
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