治疗生殖器疱疹，一般选择口服抗病毒的药物。
如果是第一次出现生殖器疱疹，也就是原发性生殖器疱疹，一般病情会比较严重，患者可能还有发烧、皮疹增多、淋巴结肿大等症状。可以选择以下三种治疗方案：
①阿昔洛韦200毫克，每天吃五次；
②伐昔洛韦300毫克，每天两次；
③泛昔洛韦250毫克，每天三次。不管使用哪一种方案，都要坚持服药7—10天。
得过生殖器疱疹，再复发就是复发性生殖器疱疹，治疗的药物和剂量跟原发性疱疹是一样的，但疗程只要5天。
如果一年复发6次以上就属于复发频繁的生殖器疱疹，可以采取长期抑制疗法，每天口服阿昔洛韦两次，每次400毫克，或者每天口服伐昔洛韦一次，每次300毫克，持续四个月到一年。
如果某一处的水疱、糜烂比较严重，吃药的同时还可以在患处涂阿昔洛韦软膏、泛昔洛韦软膏或干扰素凝胶，可以抑制病毒的繁殖，减少病毒的传播。对于一些病情比较严重，比如糜烂面大、坏死及溃疡，疼痛剧烈，或者有疱疹性脑膜炎、肝炎、肺炎等严重并发症的患者，可以静脉输阿昔洛韦，及时控制症状。
