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耐药性基因已从养猪场扩散至全世界

 桃子的图书馆zt 2018-04-02
耐药性基因已从养猪场扩散至全世界

根据伦敦大学学院(UCL)和北京大学人民医院主导的一项研究,再一次给抗生素耐药问题敲响警钟:一种抗生素耐药性的基因,已经从中国的养猪场传播到世界各地的病人当中了。

这项近日发表在《Nature Communications》上的研究显示,目前已扩散至全球各地的mcr-1基因的起源,可以追溯至2005年的一个特殊事件——当时它从猪身上转移到影响人类的病原体中。

耐药性基因已从养猪场扩散至全世界

研究第一作者Francois Balloux教授(UCL遗传学,进化与环境)说:“mcr-1在全球扩散的速度着实令人惊讶。”

mcr-1基因使细菌对粘菌素产生耐药性,粘菌素是为数不多的能够有效应对多重耐药性感染的药物之一。它在上世纪50年代被发现,但是因为其严重的副作用,所以直到最近才被主要应用在养猪业。随着最近抗生素耐药性的增加,它现在在临床上已经被广泛当作治疗感染的最后一道防线,例如对抗大肠杆菌和肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)。

Balloux教授说:“mcr-1产生的耐药性相对较低,与mcr-1相关的感染仍然可以被粘菌素治疗,但是需要很高的剂量,而这对患者是有明显伤害的,因为粘菌素具有毒性。如果出现粘菌素耐药性高于mcr-1的分子并大规模传播的话,而这会使情况更加糟糕。”

mcr-1基因是移动的且质粒携带的,也就是说它可以从一种细菌转运到到另一种细菌,甚至是两个不同的物种,并产生针对粘菌素的耐药性。mcr-1于2016年在中国被首次确认,人们很快意识到它已经蔓延至全球了,但是它的准确起源和扩散路径尚未确定。

耐药性基因已从养猪场扩散至全世界

图像来源:《Nature Communications》

该研究团队通过对来自五大洲的人和农场动物的457个mcr-1阳性基因组序列进行了详尽的数据分析,对110种细菌的基因组进行测序,并系统地挖掘了公开可用数据库中的基因组数据。

他们利用新型计算工具对这些数据进行了分析,从可靠的记录中发现了mcr-1出现的单一事件,可以准确地追溯到上世纪初中期的中国的养猪厂。他们还重构了mcr-1通过搭载各种细菌移动基因,传播到各种细菌病原体中并在全球范围内传播的过程。

该研究首次重现了抗生素耐药性的出现和传播,并为利用基因工具提升全球的抗生素耐药性监控开辟了新的道路。

耐药性基因已从养猪场扩散至全世界

图像来源:《Nature Communications》

全世界的医院都在为日益增长的、难以治疗的抗生素耐药性细菌感染而发愁。世界卫生组织发出了后抗生素时代的警告,即轻微的感染都可能变得无法治疗。英国公共卫生署预测,到2050年时,抗生素耐药性可能会导致每年1000万人死亡,并给全球经济造成66万亿英磅的损失。

Balloux教授说:“目前关于牲畜养殖中使用抗菌剂是否会导致抗生素耐药性公共健康危机并未达成共识。也就是说,在农业中使用抗菌剂不仅仅是科学问题,也是必须要解决的社会和经济问题。”

他补充说:“考虑到现阶段非常缺乏新的抗生素,我们最好的希望是管理好现有的药物来避免当前的公众健康危机,利用好细菌基因组测序的潜力,并将其用于改善监测和诊断工具。”

UCL的Lucy van Dorp博士说:“我们的研究表明,对成百上千种耐药性细菌进行分析以追踪危险的耐药性基因如何扩散至全世界是有价值的。通过解读这些细菌的遗传密码,我们发现不仅能够预测mcr-1从何地开始扩散,还能知道它从何时开始扩散。这一点非常重要,因为mcr-1从出现到在全球不同种类细菌中传播只用了仅仅十年,显示出了这些抗性基因极易传播的特性。”

研究人员之一Liam Shaw说:“我们的研究表明,在mcr-1出现在一个可动遗传因子上之后仅仅十年,它就已经遍布全球了。虽然我们还不知道它的准确传播路径,但是我们可以推测,其他的抗菌素耐药性(AMR)基因也将会以类似的方式传播。这表明,AMR是真正的全球威胁,需要国际合作来应对。”

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