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《自然》发表新研究:全世界的酵母都起源于中国

 stingray928 2018-04-19

面包师用的酵母,酿酒师用的酵母,以及受感染的脚趾甲中的酵母,它们可能源自同一个祖先。

一组来自法国的科学家准备对1,000个酵母基因组测序,他们考察了来自各个地方的酵母菌株,其中一些是你能够想到的:啤酒、面包、葡萄酒。

《自然》发表新研究:全世界的酵母都起源于中国

还有一些则不然:污水、白蚁丘、树皮、一个4岁澳大利亚女孩受感染的脚趾甲、带有油污的沥青、来自朝鲜的发酵橡子粉、马粪、果蝇、人的血液、海水、腐烂的香蕉。

五年来,两位遗传学家——分别是来自法国蔚蓝海岸大学(Université Côte d’Azur)的吉安尼·利蒂(Gianni Liti),以及来自斯特拉斯堡大学(Université de Strasbourg)的约瑟夫·沙赫雷尔(Joseph Schacherer)——会向他们遇到的几乎所有人索要酵母菌株样本,对象可能是法属圭亚那收集人类粪便的医生,也有可能是墨西哥的龙舌兰酒酿造师。

“采集1,000种葡萄酒酵母菌株很简单。”沙赫雷尔说,“但那不是我们想要的进行方式。”他们想要的是,采集生活在世界各地不同环境中鲜为人知的野生酵母菌株。沙赫雷尔和利蒂想要得到这些样本,以观察它们是否可以证实自己对于酵母起源的猜想。

他们的分析结果显示,全世界各地的酵母都起源于中国。这一结果发表在《自然》杂志上。

最有说服力的线索是,中国及周边地区酵母的遗传多样性比世界其他任何地方都要高。利蒂之前就有过这样的猜想,他曾跟在偏远地区原始森林中采集酵母菌株的中国研究人员进行过合作。不过,这次大规模基因组测序证实了东亚地区酵母的独特性:在台湾岛和海南岛这两个中国沿海热带岛屿之间,酵母菌株的遗传差异比远隔大西洋的美国和欧洲两地还要大。

《自然》发表新研究:全世界的酵母都起源于中国

酵母的中国起源说和人类的非洲起源说并没有太大的不同。

在全世界范围内,非洲地区智人的遗传多样性是最高的。世界其他地方的人类都是走出非洲的智人种群的后裔;世界其他地方的酵母也都源于扩散到东亚地区以外的酵母菌株。在野生酵母菌株“走出亚洲”之后,人类可能对它们进行了多次驯化,以制造我们如今所熟知的发酵食物:啤酒、面包、葡萄酒。

酵母菌株彼此之间的差异同样令人感到意外。衡量遗传差异的一种标准做法是,从两组不同的酵母菌株中选取同一个基因,然后对比它们之间的遗传编码发生了多少变化(就像是随着时间推移而累积起来的拼写错误)。但利蒂和沙赫雷尔发现,一种特定基因在基因组中重复(这种现象被称为拷贝数变异)的次数事实上导致了两种菌株(比如用来酿造美味啤酒的菌株和寄生在野外昆虫身上的菌株)之间的差异。换句话说,重要的不仅仅是基因的序列,还包括酵母基因的拷贝数。

莱斯特大学(University of Leicester)的酵母遗传学家艾德·路易斯(Ed Louis)表示,这种情况可能也存在于其他物种身上,甚至可能包括人类。然而,研究人类的拷贝数变异并没有那么容易,因为人类的基因组数量是酵母的200多倍。所以,举例来说,寻找跟心脏病有关基因的研究通常是对基因组进行抽样检查,以此寻找单点突变。这项关于酵母的研究表明,或许人类遗传学家也应该更仔细地研究一下拷贝数变异。

把源自微小的单细胞酵母的洞见应用在巨大的多细胞人类身上,这其实没有那么牵强。人类和酵母有很多细胞机制是一样的——在很多情况下,你可以把酵母的一个基因替换成相应的人类版本,之后酵母的机能仍然正常。由于酵母菌株可以在实验室中迅速繁殖和生长,长久以来科学家一直利用它们来进行遗传学研究。

加州大学洛杉矶分校(UCLA)的遗传学家利奥尼德·克鲁格利亚克(Leonid Kruglyak)把这项新研究称为“信息宝库”,他已经在筹划基于该研究的一些数据开展实验。荷语天主教鲁汶大学(KU Leuven)的遗传学家凯文·韦斯特里彭(Kevin Verstrepen)曾对用于酿造啤酒的多种驯化酵母菌株进行基因测序,他同样对这项新研究充满了兴趣,称:“酵母学界的每个人都感到非常兴奋。”

《自然》发表新研究:全世界的酵母都起源于中国

你是否好奇野生酵母是否可以用来酿造啤酒?答案是:可以。酵母就是酵母,它们能把糖分转化为酒精。不过,别指望酿出来的啤酒能有多好。

“我们酿过不少,”韦斯特里彭说,“酿出来的啤酒有点臭。”

翻译:何无鱼

校对:其奇

编辑:漫倩

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