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FilmArray微流控芯片解密--第一部分

 集美大哥 2018-05-20

第一部分:公司产品简介

1.1BioFire公司Logo


BioFire公司的FilmArray微流控芯片是目前已经成功商业化的微流控产品的经典之作,该芯片采用巢式多重PCR分析技术,对同一个血液样品进行一次测试便可以检测多达24种病原体,并且整个检测过程比传统PCRRT-PCR方式要快得多,只需要大约一个小时的时间,非常适合于传染病的早期快速筛查。如下图分别是FilmArray测试仪器和芯片实物图。

1.2FilmArray测试仪器实物图及各结构说明


1.3:呼吸道感染检测芯片及结构说明(图中液体仅仅为了可视化,实际测试芯片不含有液体部分)


目前,在BioFire公司官方网站上已经公布了四种测试芯片,分别是:呼吸道感染检测芯片,血液感染检测芯片,胃肠道感染检测芯片,脑膜炎感染检测芯片。虽然四种芯片针对的疾病不一样,所需要检测的样品种类也不一样,但是产品外观上基本一致,可以参考图1.3中呼吸道感染检测芯片的外观结构。


1,呼吸道感染检测芯片

呼吸道感染检测芯片是BioFire公司最早开发出来的产品,也是目前该公司发展最为成熟的检测芯片。早期的呼吸道感染检测芯片可以在一个小时之内检测多达20种不同的呼吸道细菌和病毒等病原菌。目前,该公司已经开发出基于FilmArray2.0检测系统的新型呼吸道感染检测芯片,相比于早期的检测芯片,该新型芯片可以在45分钟之内完成测试,并且比早期芯片更准确,更高效,更快速,检测的病原菌种类也更多(21种)。如下为该新型呼吸道检测芯片可以检测的细菌和病毒种类:

1.4:新型呼吸道感染检测芯片可以检测的病原菌列表


2,血液感染检测芯片

血液感染能引发全身炎症反应综合症,并可能发展为重度脓毒症和感染性休克,导致血液感染患者死亡率大大增加。此外,为了防止出现耐药性,临床医师必须尽早开始有效治疗且避免让患者过度接触广谱抗生素。因此,实验室快速鉴定病原菌以及耐药机制,对于选择合适疗法上极其关键。常规培养和药敏试验可能需要72小时才能出结果。

而FilmArray BCID Panel血流感染检测芯片可全面检测与血流感染相关的24种病原体靶标以及3种抗生素耐药基因,在血液培养标记为阳性(使用血液培养设备)后1小时内出结果。

该检测芯片主要针对病人血液中病原菌感染进行检测,可以同时对多达24中病原菌(包括革兰氏阳性菌,阴性菌,和致病酵母菌)和3种抗生素抗性基因进行检测。如下图为可以检测的病原菌种类。

1.5:血液感染检测芯片可以检测的病原菌及耐药基因列表


3,胃肠道感染检测芯片

传统的胃肠道感染检测方法难以通过临床表现来确定具体的病原菌,临床医生只能通过细菌培养,同时对患者的粪便进行虫卵和寄生虫检测,但是该传统检测方法局限性比较多,比如测试时间长,需要3-5天才能得出结果,灵敏度低,需要专业技术人员才可以进行检测等。

FilmArray的胃肠道感染检测芯片可以对导致胃肠道感染的常见22种病原菌进行同时检测,同样,只需要1小时便能得出检测结果,该检测由仪器自动完成,不需要专业技能人员,也不需要复杂的细菌培养等实验环境。

1.6:胃肠道感染检测芯片可以检测的病原菌列表


4,脑膜炎感染检测芯片

脑膜炎(meningitis)系指软脑膜的弥漫性炎症性改变。由细菌、病毒、真菌、螺旋体、原虫、立克次体、肿瘤与白血病等各种生物性致病因子侵犯软脑膜和脊髓膜引起。细菌性脑膜炎是一种特别严重的疾病需及时治疗,如果治疗不及时,可能会在数小时内死亡或造成永久性的脑损伤。

脑膜炎的实验室检查比较复杂,需要根据血象,脑脊液等进行细胞计数,并且还需要通过免疫法来对细菌抗原进行检测,其他的辅助检查手段还包括有X射线摄影检查,CTMRI检查等,这些检查不仅加重了病人的疼痛程度,而且检测时间长,检测成本高。

FilmArray的脑膜炎感染检测芯片则可以快速的(1小时),准确的(采用巢式PCR法)对导致脑膜炎的常见14中致病菌,病毒和酵母进行同时检测,这些病原菌会感染患者的中枢神经系统,在严重的情况下甚至能威胁患者生命。

1.7:脑膜炎感染检测芯片可以检测的病原菌列表

虽然目前BioFire只有四种检测芯片发布,但是在不久的将来,会有更多的测试芯片通过FDA或CE的认证而面向更多种类的疾病检测。


1.8FilmArray2.0系统是由多个FilmArray仪器组成的阵列

 

与其他POCT产品一样,FilmArray也是采用测试仪器和一次性测试芯片的模式来进行检测,但是纵观这四种检测芯片,FilmArray的产品相对于市面上其他疾病检测芯片来说,具有非常明显的竞争优势:

1,全面综合性强:该产品并非从单一的某种致病菌的角度,而是从整体的疾病的角度来设计检测芯片,这对于只出现某种症状而不清楚致病菌种类的患者来说,可以同时对导致该症状的多种致病菌进行同时检测,逐一排除筛查最终便可以定位导致疾病的病原菌,进而采取必要的治疗手段来治疗。这种同时检测多种致病菌的功能主要得益于芯片中多重PCR技术的实现。

2,快速检测:1个小时便可以得出检测结果的测试芯片在目前来说,非常具有应用前景。

3,特异性高,灵敏度高:由于测试芯片采用巢式PCR技术,故可以最大程度的排除其他非特异性病原菌核酸物质的干扰,同时两步PCR扩增也能够保证在极低病原菌含量的情况下也能快速的检测出来,从而提高了芯片的检测灵敏度。


(关于BioFire公司的发展历程,投资背景,以及被生物梅里埃所收购等具体信息,各位可以翻阅本公众号转载的医业观察的文章:“26期:分子诊断精品之二生物梅里埃FilmArray多重PCR分析仪”。)



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