多尺度上多样性的分解

第一层：生态系统水平上的总多样性(ɣ_Ecosystem)可以分解为生态系统栖息地内部的平均多样性(ᾱ_{EcosystemHabitats})和栖息地之间的多样性(β_{InterHabitats})。公式为(ɣ_Ecosystem - ᾱ_{EcosystemHabitats}= β_{InterHabitats})。

第二层：生态系统栖息地内部，每个栖息地总多样性(ɣ_Habitat)等于将每个栖息地当做一个生态系统水平上的本地群落(α_{EcosystemHabitat})的多样性。即ɣ_Habitat = α_{EcosystemHabitat。}然后将ɣ_Habitat分解为平均栖息地内部的差异(β_{IntraHabitats})和本地当地群落的多样性(ᾱ_{LocalCommunities})。

最后，生态系统中总多样性=栖息地之间的多样性+平均栖息地内部的多样性+平均本地群落多样性。即ɣ_Ecosystem = β_{InterHabitats}+ β_{IntraHabitats} + ᾱ_{LocalCommunities}.

具体公式如下：

参考文献：

1. Escalas, A., M. Troussellier, T. Yuan, T. Bouvier, C.Bouvier, M. A. Mouchet, D. Flores Hernandez, J. Ramos Miranda, J. Zhou, and D.Mouillot. 2017. 'Functional diversity and redundancy across fish gut, sedimentand water bacterial communities', EnvironMicrobiol, 19: 3268-82.

https://onlinelibrary./doi/abs/10.1111/1462-2920.13822

2. Escalas A, Bouvier T, Mouchet M a., Leprieur F,Bouvier C, Troussellier M, et al.(2013). A unifying quantitative framework for exploring the multiple facets ofmicrobial biodiversity across diverse scales. Environ Microbiol 15:2642–2657.

https://onlinelibrary./doi/epdf/10.1111/1462-2920.12156

3. Belmaker, J., Ziv, Y., Shashar, N., et al.(2008) Regional variation in the hierarchical partitioning of diversity incoral- dwelling fishes. Ecology 89: 2829–2840.

https://esajournals.onlinelibrary./doi/epdf/10.1890/07-1464.1

---

一个环境工程专业却做生信分析的深井冰博士，深受拖延症的困扰。想给自己一点压力，争取能够不定期分享学到的生信小技能，亦或看文献过程中的一些笔记与小收获，记录生活中的杂七杂八。