GMP洁净室处于药厂生产核心地位，其洁净效果直接影响药品的质量。洁净室的坏境若受到污染，那么药品治疗就难以保证，这样的药品就会延误或者加剧患者的病情，给患者带给巨大身体的危害和不良的社会效应，因此保证制药洁净室的洁净是药企关注的焦点。如生物制品是制药工业的一部分，对生产厂房有很高的洁净要求。曾在市售的嗜酸乳杆菌产品中，分离到人为污染的短乳杆菌、发酵乳杆菌和植物乳杆菌等。生物制品生产中，尤其是活菌、活疫苗的生产中，经常受到不同程度的污染，因此，不仅需要重视洁净室的建立，更要重视质量控制方法及标准。
药品是关乎国计民生的重要行业，提高制药质量是每个药企义不容辞的责任，而加强洁净室的洁净更是值得药企密切关注，以制药行业洁净服为例，其看似简单，实则关系重大，因为人体的毛屑脱落同样会导致药品污染。洁净室的工作服是为了将工作人员的粒子限制在最小范围之内，洁净服必须是发尘量少的洁净面料。
净室的清洁程度直接关系到产品车间的质量问题，所以在做洁净室、无尘车间、净化车间的清洁时一家要多考虑多个方面。制药企业需要严密加强人员管理，严格控制人流物流，合理布局空间与面积等以保证制药洁净室的洁净度。
另外，提高设备的技术水平也是保证GMP制药洁净室的有力方面。据悉，洁净室设备的材质、加工精度、密闭程度以及管理制度都与交叉污染有关。因此提高设备的自动化水平，以减少操作人员，是防止交叉污染的必要措施。有行业人士表示，无菌隔离系统是完全密封的，将药品、生物制品控制、并处理成无菌状态。采用隔离操作技术可最大限度的防止产品受到污染，保护操作者的安全，避免受到毒性物质的伤害。
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