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跟你说单细胞研究大火,那是有原因的

 人老颠东 2018-07-19

细胞是生物体基本的结构和功能单位。近年来,单细胞的研究格外火热,多篇 Nature、Cell 的高分文章都是通过单细胞水平研究获得的。尤其在肿瘤领域,单细胞研究可以很好的避免肿瘤异质性的干扰。下文以顺铂化疗的耐药机制为例,呈现了单细胞研究的多种方法。拉到文末可免费领取实验方案资料。



顺铂耐药的分子机制


顺铂(Cisplatin)是 1978 年经 FDA 批准用于临床治疗癌症的化疗药物。顺铂药物的治疗机制是通过形成 Pt-DNA 复合物,干扰 DNA 复制合成,从而杀死癌细胞,属于细胞周期非特异性药物。许多癌症患者在用药初期对铂类的治疗比较敏感,但一段时间后,患者通常对顺铂治疗表现出耐药性,导致癌症复发。


因此在化疗后细胞必须修复 DNA 损伤,否则 DNA 复制受阻会导致细胞死亡。对于顺铂的耐药机制研究,也是目前抗癌药物研究热点。主流的三个研究方向分别是 DNA 修复加速、胞浆失活加速和细胞摄取药物能力的变化。其中,细胞摄取药物能力的变化主要表现在细胞对顺铂的摄入能力降低及转运加速



单细胞水平顺铂摄入研究[1]


细胞内顺铂的摄入与肿瘤负荷相关,也就是说肿瘤对顺铂反应降低会导致细胞内顺铂的含量降低。所以,分析单个细胞水平对顺铂的摄入和分布对于评估治疗的有效性具有非常重要的意义。过多顺铂进入细胞内会增加 DNA 损伤和细胞死亡的频率。了解单个细胞水平及细胞亚群对顺铂的摄入的机制将能为新疗法的开发提供科学依据,以改善肿瘤对顺铂的耐药性,降低肿瘤复发率。


单细胞 ICP-MS NexIon2000



单细胞电感耦合等离子体质谱SC-ICP-MS)是以单颗粒电感耦合等离子体质谱技术为基础,测量单个细胞(或单个纳米颗粒)在进入等离子体时产生的离散信号,实现对溶液中的金属元素进行评估与定量。每个细胞中的金属成分离子化,产生离子流,检测器以每秒 100 000 数据点的速度快速对信号采集测量,从而使得单个细胞中的金属含量能被定量到阿克(ag)/ 每细胞的水平。相比测量细胞内顺铂摄入的传统方法,SC-ICP-MS 所得结果的信息量更加全面。



通过对两株卵巢癌细胞系 A2780(顺铂敏感型)和 A2780/CP70(顺铂耐药型)顺铂摄入量的实时检测发现:相比 A2780 敏感细胞系,顺铂摄入在耐药性的 A2780/CP70 细胞系上水平降低;但顺铂摄入的细胞差异不是由于细胞周期的不同,因为血清饥饿细胞并不改变顺铂的整体摄入。顺铂摄入的胞内差异性是由于其他尚未确定的因素造成的




单细胞水平中心粒扩增研究


「三阴性」乳腺癌(Triple-Negative Breast Cancers, TNBC)是指雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)和人表皮生长因子受体(HER2)均阴性的一种特殊类型乳腺癌。「三阴性」乳腺癌约占所有乳腺癌的 10-20%, 但因其缺乏内分泌及抗 HER2 治疗的靶点,目前治疗尚以传统外科切除、化疗及放疗为主。铂类药物化疗是当前针对晚期乳腺癌的标准治疗方案。[2] 顺铂类药物已被报道通过解偶联 DNA 复制周期和中心粒复制调控造成中心粒扩增,从而抑制肿瘤细胞增殖。[3]


2018 年,Nirmech Patel 等人在 Nature communication 杂志上发表了相关研究。他们结合整合基因组学、RNAi 技术和功能型验证,对乳腺癌和非恶性细胞上的 130 多个潜在基因研究发现,有 13 个基因簇通过影响细胞周期检验点、DNA 损伤应答和恶性细胞选择性分裂上调「三阴性」乳腺癌发病倾向。其中 KIFC1 驱动蛋白作为高选择性的恶性细胞靶标,通过顺铂化疗与 KIFC1 联合协同效果的研究结果进一部表明,KIFC1 最有潜力成为新型药物靶点。[4]



在研究顺铂化疗药物与 KIFC1 协同治疗实验设计中,两个关键的单细胞水平研究方法:中心粒扩增打分和多极性有丝分裂实验,都是使用 Operetta 高内涵成像系统进行共聚焦高分辨率图像采集后,再通过 Hamony 软件对中心粒扩增和多极性有丝分裂进行自动数据分析及数据挖掘。


高内涵成像系统 Operetta CLS


· 中心粒扩增打分实验设计


为在乳腺癌细胞模型上确认 KSFC1 与中心粒扩增的相关性,11 种乳腺癌相关的细胞株用于中心粒扩增打分实验。免疫荧光方法标记中心粒组装关键蛋白激酶 Aurora A(绿色)和中心粒标记物 CP110(红色),Hoechst 标记细胞核(蓝色),通过 Operetta 高内涵成像获取高分辨率图像,如下图 b 中所示,Low CA 组中心粒数量、荧光强度和面积都远低于 High CA 组,后续通过 Hamony 软件对中心粒扩增进行分析打分,发现针对 KIFC1 基因的#2/#4/#5/#6 四组 SiRNA 能有效增加 KIFC1 依赖的中心粒扩增。



· 多极性有丝分裂实验设计


免疫荧光标记 Aurora A(绿色)和双极有丝分裂驱动蛋白 Eg5(红色),Hoechst 标记细胞核(蓝色),通过 Operetta 高内涵成像获取高分辨率图像及 Hamony 软件进行多极性有丝分裂分析打分,发现在 3 株中心粒高扩增的细胞系和 4 株中心粒低扩增细胞系中,KIFC1 沉默都能显著提高单个细胞的纺锤体数量,造成有丝分裂多极性(下图 a-b)。并且通过在 MDA-MB-231 细胞株上的实时动态检测进一步验证了 KIFC1 沉默对有丝分裂多极性的影响(下图 c)。


图片来源:Nature Communicatio

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