下面以使用Graphpad Prism 6软件作生存曲线图为例给大家讲解一下。 作图首先来源于实验数据,比如给两组小鼠(分别为group1和group2)药物来诱导小鼠死亡,连续跟踪7天,观察小鼠的死亡情况,1表示死亡;0表示没死。
根据以上观察的结果就可以使用Graphpad作图来比较两组的生存率是否有变化。 打开Graphpad Prism 6软件,选择survival作图一栏,点击下方create创建一个新的工作界面。 此时便可将之前观察到的数据填入作图软件中。X轴表示死亡时的天数。同样,1表示死亡;0表示没死。 点击左下方的Date 1便可以获得作图结果。 在左边survival of Data 1一栏中寻找curve comparison这一栏还可以获得数据的分析结果,是否有显著性差异以及p值的大小。 可以看到,通过mantel-cox分析,group 1和group 2两组具有显著性差异,p值为0.0169。 当然,这是在两组的情况下,在你获得结果时便可自动计算出p值,但是如果多组的话便需要你自己进行两两比对,如下以三组为例,将实验数据填入软件中。 点击上方的Analyze,找到survival curve一栏,这样便可以选择想比较的任何两组,去掉group2,比较剩下的两组。 选择ok后,可以看到input一栏,在上方我们使用1表示死亡;0表示没死。因此在Death/Event一栏填1,censored subject一栏填0。 Output一栏中,选择常用的95% Cl后由两个选项,一般选择Asummetrical。 点击ok后,我们便可以获得group 1 和group 3的比较结果,同样也具有显著性差异,p值为0.0124。 生存曲线在临床医学中经常会用到,小伙伴们可以试试额。 |
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