导言 首先说一下,什么是生存率? 生存率乃指某生物种群内的每一个体经过一定时限以后生存的机率。如以横轴为经过的时间(日、月或年),纵轴为生存率,则可绘出生存曲线。根据生存曲线的类型可以判断生物种群死亡的规律[1]。 目前临床或者生命科学领域最常用生存率曲线(也称Kaplan-Meier曲线)来描述各组患者的生存状况或者各组实验动物的存活情况。 所以呢,我们今天介绍一种比较简单地生存曲线的绘图方法。 软件 Graphpad 图文教程 动物实验 动物实验的话,因为受到人为控制,所以死亡和未死亡的都可以统计到,不存在删失的情况。所以,转换为生存曲线作图数据一般是从1到1,或者从1到0。没有从1到0,再到1,再到0的情况。 这里的话,我们设置两个组,分别为模型组和给药组,每组动物共10只。表格里面记录的是当天存活/剩余的鼠的数量,一共测了15天。 接下来,我们将上述数据处理为作图使用的数据。 (一)假设15天为实验的终点 模型组,从第一天开始给药物就出现死亡,死亡1只,所以天数记为1,作图数据记为1,中间未出现死亡的天数不计。而到了第11天,死亡三只,所以天数记连续3个11,作图数据记为1,也就是在哪一天,死了几只,就罗列几个天数,计数为1。 1. 打开Graphpad软件,选择生存曲线分析 8. 最后,你可以给图形拉一个框(个人喜好),然后你就可以将图形导出了 9. 当然,上述举例的是两组的比较,如果是多组的话怎么办,你就得两组进行两两比较了,选择analyze,选择分析中的生存曲线,将想要分析的两组进行选择。 10. 看一下,这里有默认设置,死亡为“1”,存活或删除为“0”。 11. 然后在Results中,你就可以看到两组对比的差异性了。 如果假设第10天是实验的终点,那么数据的处理如下,到第10天,存活的全部记为0。总数加起来依然是10,这也是核对自己是否统计遗漏的办法。 作图的话,按照上述作图方法进行作图即可。 (三) 临床实验数据 1. 点击生存曲线绘图,这里使用软件提供的数据。 2. 我们会发现,他的数据是从1到0,再从0到1,这是因为在第46天,有病人联系不上,或者其他原因不参与实验,但是又在好好生活,所以为存活,作为删失数据,记为0。 3. 作图如上述所示,最终我们会发现,做的图中会出现短线,这就是因为有删失数据。 4. 怎么样,你明白了吗? 参考文献 [1] 辛毅,于夫主编.科技采编手册.郑州:河南科学技术出版社,1986.10:33 最近公众号改版, 以防失联,加个星标吧! |
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