天气这么热,除了空调、一只冰镇大西瓜之外,了解最新科研进展也是极好的,毕竟新的学期大家不是为毕业发愁就是要为申国自然发愁了,我们公众号也会在接下来对各个热点科研领域进行大梳理,也方便大家探索科研思路,寻找基金亮点。 long noncoding RNAs的生与死 今天我们讲的是长链非编码RNA(lncRNA)的最新的文献综述。众所周知,lncRNA研究者众多,成果斐然,所以前期对其特性、作用机制、研究方法的综述已经非常多了,而今年涌现出来的综述文章更多地是聚焦到了某一类疾病或者某类细胞功能:内分泌系统肿瘤、神经系统、昼夜节律、免疫细胞稳态、心血管疾病、心脏再生、细胞核内功能研究、外泌体类lncRNA、细胞器功能调控等等,大家一睹为快。 (1)Cell:lncRNA有cis调控和trans调控 Functional Classification and Experimental Dissection of Long Noncoding RNAs lncRNA的调控方式分为cis调控和trans调控,这里大神给咱们理清了思路 ①测序了解差异表达的lncRNA的染色质位点 ②lncRNA的过表达、敲减→临近基因转录是否改变? ③如果临近基因转录改变→PolyA信号序列插入→如果基因表达有差异,可以考虑是因为lncRNA的转录或者剪接体导致的;如果基因表达没差异改变,则可以考虑lncRNA上面有DNA调控元件; ⑥如果临近的基因转录没改变→FISH细胞内定位→根据lncRNA的定位以及二级结构、序列和蛋白结合序列预测靶标RNA、DNA、蛋白→利用RNA、DNA、蛋白研究工具证明两者结合 (2)lncRNA作为亚细胞器元件 大量的lncRNA研究很多集中在细胞核内,但是lncRNA也能参与到脂类、细胞膜蛋白以及其他失活的蛋白调控,与之形成有效的调控元件,形成亚细胞器单元。
A:参与染色体折叠Paraspeckle;B:参与细胞膜细胞转导;C:外泌体分泌
(3)lncRNA作为亚细胞器元件 免疫系统有多重免疫细胞协同作用,对于外源物质、细菌病毒等的入侵,需要及时做出应答机制反应,而在这其中大量研究表明,lncRNA在转录水平以及转录后水平参与免疫细胞免疫应答调控。
LncRNA调控天然免疫细胞功能 LncRNA调控获得性免疫细胞功能
(4)lncRNA与昼夜节律 昼夜节律自从获得了诺贝尔奖,研究也更为大家所关注,这篇综述文章对lncRNA参与调控动物的昼夜节律进行的总结。本文从lncRNA、miRNA等分子对于昼夜节律相关基因的RNA转录、蛋白翻译等维度进行了回顾。 Cardinal Epigenetic Role of non-coding Regulatory RNAs in Circadian Rhythm
(5)lncRNA Cryano与神经系统的发育 这个Cryano最近非常知名,不仅发了Cell,而且还发了一篇Nucleic Acids Research(IF=11.56分),而且都是研究其和神经系统发育有关。 circRNA Cdr1as和miR-671的ceRNA网络通过miR-7为媒介,调控着LncRNA Cyrano和miR-7的ceRNA网络,从而形成了一个特别复杂的双ceRNA网络分子机制(满满的韩剧四角恋爱剧情有没有啊) 而这一篇文章中,来自父母代的lncRNA Cyrano可独立于子代的同一条lncRNA Cyrano,深刻影响这子代的神经系统发育,如果母代的lncRNA Cyrano被沉默,子代的神经系统发育便会受影响,即便子代会自己产生lncRNA Cyrano。
(6)lncRNA与心血管疾病 心脏疾病的威胁一直以来都是高于肿瘤的,例如心肌梗死导致的心衰问题,有诸多研究表明lncRNA在其中发挥着重要的调控或者促进作用,针对这些lncRNA研发抑制剂或者增强这些lncRNA的表达有助于心脏功能的恢复和治疗。
(7)lncRNA与心血管疾病 该综述回顾了lncRNA和breast, prostate, endometrial以及thyroid系统肿瘤的关系
Pubmed中breast, prostate, endometrial以及thyroid肿瘤相关lncRNA、miRNA文章数据统计
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来自: 珊vog70jt7a9q4 > 《lncRNA》