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慢病毒的使用

 迷途中小小书童 2018-10-02

病毒载体是基因工程研究中的一柄利器。运用它,我们可以高效地让目标基因过表达或者被特异性地敲低。科研中用到的病毒主要有慢病毒、腺病毒、腺相关病毒。根据各种病毒不同的特性,不同的课题需要包装不同的病毒。比如,腺相关病毒更适合进行动物体上的研究。腺病毒具有包装容量大、适合瞬时表达的研究等。


各类病毒类载体中,生物基因科研中使用得最多的是慢病毒载体。慢病毒具有可插入外源基因容量大、目的基因整合靶细胞基因组稳定表达、可同时感染分裂期和非分裂期的细胞、侵染效率高的特点,已经广泛应用于基础科研、临床研究中,比如抗体、CAR-T的制备。

首先,要做预实验!


文献报道或他人经验中的MOI值(multiplicityof infection,即感染复数,含义是感染时病毒与细胞数量的比值)只可作为参考,其受大量不确定因素的影响,如特定病毒对细胞的亲噬性、不同滴度测定方法的误差、过程损耗、细胞状态、传代次数、细胞密度、实验操作等。实际情况在各个实验室也会存在一定差异。预实验的目的是找出能够达到最高感染效率、同时细胞状态不会受到明显影响的一个恰当的病毒用量。


预实验方案!


设置不同MOI值的感染组。举个例子:可设立5、10、20、50的MOI值梯度,各两孔,其中一孔加入终浓度为5 ug/ml的polybrene(聚凝胺,用于提高病毒感染细胞的效率)。如果只需通过荧光显微镜观察,则使用96孔板(细胞量参考文末的列表)即可。如需做Real-time PCR或流式检测则至少使用24孔板。在24 h换液,在72 h左右检测感染效率及表达水平。


如果有文献报道的MOI值(参考文末的列表),可使用该值的0.5x、1x、2x、4x进行测试。如使用较难感染的细胞(如悬浮细胞、某些原代细胞等)进行实验,建议设置易感染细胞组如293T作为对照。

以24孔板为例~

第一天,铺板靶细胞。在24孔板中接种目的细胞约5x104/孔,每孔完全培养基0.5 ml。靶细胞的状态对于感染及表达非常重要。

第二天,取出病毒置于4℃冰箱或冰袋上融化,如需稀释毒液可以用完全培养基进行稀释。观察靶细胞,进行病毒感染时细胞应状态良好,汇合度在50-60%左右。

第三天,给侵染病毒的靶细胞换液,放入培养箱培养48h。

第五天,按照正常培养基条件继续培养48 h后可检测感染效率。在倒置荧光显微镜观察细胞的荧光表达情况,估计慢病毒感染目的细胞的效率。如未携带荧光标记元件的,可以通过Real-time PCR检测目的基因表达。慢病毒表达产物在侵染后的72-96 h左右达到高峰,如细胞生长代谢缓慢需适当延长时间,生长旺盛的细胞在48 h即可观察基因表达。

正式实验!


根据预实验结果,按滴度计算毒液所需的用量。如原始滴度为1x108TU /ml,每孔计划使用病毒用量为0.5x106 TU,则需要使用原液5 ul。将所需用量的毒液加入完全培养基(500ul)、混匀。移除孔板中的上清,加入混合病毒液。放于二氧化碳培养箱(37℃、5%CO2)孵育培养。如靶细胞状态良好可在12-24h更换培养基,病毒孵育时间不短于48 h。需要使用polybrene时,在孵育培养基中先于病毒液加入,且终浓度5 μg/ml。

收尾!


上述实验所使用过的所有废弃物,均需要完全浸泡在3-5%的84消毒液中至少1h,然后沥干经过高压灭菌处理,目的是使其中的生物活性完全消灭。有条件的,建议完全焚烧。


未用完的病毒液,置于-80℃长期保存。需要在24h内继续实验的,可以暂存于4℃。反复冻融会影响病毒滴度,所以建议将病毒液小量分装,用多少取多少。

附表:


(1)常用细胞系参考MOI值


细胞名称

中文名称

80%感染率所需MOI

293T

人胚肾上皮细胞

1

A375

人黑色素瘤细胞

10

A498

人肾癌细胞

100

A549

人肺腺癌细胞

20

A673

人横纹肌瘤细胞

10

ACHN

人肾癌细胞

10

AGS

人胃癌细胞

100

AsPC-1

人胰腺癌细胞

10

B16

小鼠黑色素瘤细胞

>100

BEL-7402

人肝癌细胞

10

BGC823

人胃癌细胞

100

BRL

大鼠肝细胞

20

BRL-3A

大鼠肝细胞

100

BTT

小鼠膀胱癌细胞

20

C127

小鼠乳腺癌细胞

100

C6

大鼠脑胶质瘤细胞

>100

Capan-1

人胰腺癌细胞

10

CFPAC-1

人胰腺癌细胞

50

CHO

中国仓鼠卵巢癌细胞

20

CNE

人鼻咽癌细胞

10

CNE2

人低分化鳞癌鼻咽癌细胞

50

COC1

人卵巢癌细胞

>100

Daudi

人Burkitt’s淋巴瘤细胞

>100

DLD-1

人结直肠肿瘤细胞

10

DU145

人前列腺癌细胞

20

EC9706

人食管癌细胞

10

Eca109

人食管癌细胞

20

GBC-SD

人胆囊癌细胞

30

GH3

大鼠垂体腺瘤细胞

100

HaCaT

人永生化表皮细胞

>100

HCC1937

人乳腺癌细胞

50

HCT116

人结直肠癌细胞

10

Hela

人宫颈癌细胞株

10

HepG2

人肝癌细胞

10

Hep-2

人喉癌细胞

10

Hepa 1-6

小鼠肝癌细胞

100

hFOB 1.19

人胎儿成骨样细胞

20

HL-60

人急性髓系白血病细胞

>100

HL-7702

人肝正常细胞

20

HOS

人骨肉瘤细胞

20

HSC-T6

大鼠肝星形细胞

10

HT-29

人结肠癌细胞

10

Huh-7

人肝癌细胞

10

HUVEC-2C

人脐静脉血管内皮细胞

10

IEC6

大鼠肠上皮细胞株

10

JB6

小鼠表皮细胞

>100

JEG-3

人绒癌细胞系

100

Jurkat

人T细胞白血病细胞

50

K562

人慢性髓性白血病细胞

20

KB

人口腔上皮癌

10

L6

大鼠成肌细胞

50

Lewis

小鼠肺癌细胞

20

LNCaP

人前列腺癌细胞

5

LoVo

人结肠癌细胞

10

MCF-7

人乳腺癌细胞

20

MDA-MB-231

人乳腺癌细胞

10

MDA-MB-468

人乳腺癌细胞

10

MDPC-23

小鼠成牙本质细胞样细胞

>100

MG-63

人成骨肉瘤细胞株

50

MGC-803

人胃癌细胞

50

MIN-6

小鼠胰岛素细胞

100

MKN-28

人胃癌细胞株

20

MKN-45

人胃低分化腺癌细胞株

20

MOLT-4

人T淋巴细胞白血病细胞株

>100

MRC-5

人胚肺成纤维细胞

10

NB4

人白血病细胞

50

NCI-H125

人肺腺癌细胞

>100

NIH-3T3

小鼠胚胎成纤维细胞系

20

NRK

大鼠肾细胞

100

PANC-1

人胰腺癌细胞

2

PC-3

人前列腺癌细胞

20

Raw264.7

小鼠单核巨噬细胞白血病细胞

10

RKO

人结肠癌细胞

2

RPE

人视网膜色素上皮细胞

10

Saos-2

人骨肉瘤细胞

10

SCaBER

人膀胱鳞癌细胞

200

SEG-1

人食管腺癌

100

SGC-7901

人胃癌细胞

10

SHG-44

人脑胶质瘤细胞

10

SHZ-88

大鼠乳腺癌细胞

20

SK-BR-3

人乳腺癌腹腔转移癌细胞株

50

SK-N-SH

人SK神经母细胞瘤

20

SK-OV-3

卵巢癌细胞株

2

SMMC-7721

人肝癌细胞

10

SPC-A-1

人肺腺癌细胞

100

SW1990

人胰腺癌

50

SW480

人结肠癌细胞

10

SW620

人结肠癌细胞

100

SW982

人滑膜肉瘤

20

T24

人膀胱癌

5

T-47D

人乳腺癌细胞

50

Tca8113

人舌鳞状细胞癌细胞

10

THP-1

人急性单核细胞白血病细胞

50

U2 OS

人骨肉瘤细胞

5

U251

人脑胶质母细胞瘤

10

U87

人脑星形胶质母细胞瘤

3

U937

人单核细胞

50

Vero-E6

非洲绿猴肾细胞

5


 

(2)常用培养器皿使用参数


种类

底面积 (cm2)

培养基工作体积 (ml)

平均细胞产量

96孔板

0.32

0.1 –  0.2

3.2 x 104

48孔板

0.95

0.2 – 0.3

9.5 x 104

24孔板

1.9

0.4 –  0.6

1.9 x 105

12孔板

3.8

0.8 – 1.2

3.8 x 105

6孔板

9.5

2 –  3

9.5 x 105

100mm 皿

55

8 – 15

5.5 x 106

150mm 皿

152

25 –  40

1.5 x 107

T75 瓶

75

15 – 22

7.5 x 106

T175 瓶

175

30 –  50

1.75 x 107

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