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JAMA
上个月25日,JAMA刊文,题为Prevalence of Variant Reclassification Following Hereditary Cancer Genetic Testing。这是来自于德克萨斯大学西南医学中心的最新研究成果。
这项针对基因检测进行的研究,揭示了一个十分重要的问题:随着人们对于基因不断产生更多认识,对基因的分类也会持续细化,从前在基因检测时出现的意义不明的基因都会逐步产生合理解释,因此基因检测实验室应该定期回顾其测序结果,并给医生提供相关信息。
典型的基因约包含27000个碱基对(A-T,G-C),这些大量的碱基对意味着无数的潜在变异。然而并不是所有的基因突变都与疾病有关,基因突变往往被分成“良性”、“可能良性”“不确定重要性的变异”、“可能致病”和“致病性的”等几大类。随着高通量肿瘤测序和胚系基因检测的广泛应用,如何应对临床意义不明确的基因突变,是大家面临的挑战之一。
在研究团队所拥有的06年到18年的总计145万人次的基因检测数据中,有超过一半以上的病例均为癌症患者。经过对癌症患者数据的重新分析,团队发现,有7.7%(26 670中的2048)具有不确定意义的独特变异被重新分类,91.2%(2048中的1867)被降级为良性或可能是良性的,8.7%(2048中的178)升级为致病性或可能致病性变异。由于很多此类变异不止影响一个个体,因此重新分类最终影响了整个队列中25%的临床报告(46 890个,184 327个)。
由此可见,定期将已经被检测过的数据进行重新分类,确实能得到更多有效信息,而这无疑对于临床诊断治疗具有重要的指导意义。当然,在实际操作中需要考虑的问题依旧有很多,比如需要多久对分类进行一次更新?如何恰当地与先前进行检测的客户进行沟通,告知其结果已经更新?
另外值得注意的是,研究所用的145万人次的基因检测数据,均来自Myriad Genetics一家公司。而不同基因检测公司和实验室在该领域的实践存在多大差异,是否会对基因检测结果有影响,或许也是未来值得探讨的问题。
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来自: YLWUGD > 《驱动基因》
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