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基因多态性Meta分析

 太行郎中 2018-11-22

3.基因多态性的Meta分析与其他Meta分析的区别?

一、数据的结构不同 一般是,病例组和对照组的基因型通常可以用一个2×3表格形式来反映。对于一个SNP,假设其等位基因为A和T,A为野生型基因,T为突变基因,该种群中的个体可能存在三种基因型分别为AA、AT、TT,假设存在这三种基因型的受试者人数在病例组分别为a、b、c,对照组分别为d,e,f。

二、基因模型 对于基因多态性的Meta分析,有多种基因模型分别进行一次分析,其原理是对各基因型的多次两两重复比较,以减少Ⅰ类错误的概率。目前常用的5种为(假设其等位基因为A和T):①等位基因模型,T vs. A;②显性模型,(AT+TT) vs. AA;③隐性模型,TT vs.(AA+AT);④共显性模型,TT vs. AA和AT vs. AA;⑤超显性模型(AA+TT)vs.AT。

三、遗传平衡检验 提取所纳入文献的数据后,在病例-对照型遗传相关性研究中,最好对对照组进行哈代温伯格定律(Hardy Weinberg Equilibrium,HWE)检验,看样本是否来自同一孟德尔群体,以减少病例-对照研究中出现的抽样偏倚(这是由病例-对照研究的设计特点决定的)。在一个足够大的种群中,且个体间是自由交配的情况下,可以看做符合遗传平衡。

四、质量评价

现在并没有一个统计的标准。我们可以采用Clark提到的质量评价的方法《A systematic review of the quality of geneticassociation studies in human sepsis》。

五、敏感性分析

对 Meta 分析结果一般不用按照传统的方式进行敏感性分析,一般以排除对照组基因分布不符合 Hardy-Weinberg 遗传平衡定律(HWE)的研究结果与综合合并结果进行比较,看是否一致。

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