资讯编号:ZX2016001006 题目: 最常见急性淋巴细胞白血病亚型的遗传特征 研究人员: 圣犹达儿童研究医院 华盛顿大学儿科癌症基因组项目和儿童肿瘤国际研究小组 发表时间: 2016.10.24 论文题目: 《Deregulation of DUX4 and ERG in acute lymphoblastic leukemia》 期刊名称: 《Nature Genetics》 癌症类型: B前体急性淋巴细胞白血病(B-ALL) 癌症简介: 1、白血病是最常见的儿童癌症类型。 2、急性淋巴细胞白血病(ALL)占儿童癌症约30%,B-ALL是ALL最常见类型,约占80%。 研究进展: 1、目前缺乏许多B-ALL病例的遗传基础的信息。 2、目前有发现来自一些患者的血液样品中的独特基因模式,想确定该信号背后的潜在分子事件。 研究手段: 微阵列和转录组测序 研究样品: 1913名B-ALL患者(包括儿童,青少年,年轻成人) 分析要点: 1、通过对1913名B-ALL患者进行微阵列和转录组测序分析,鉴定出7.6%的患者具有描述的独特遗传谱。 2、ChIP测序分析蛋白质如何与DNA互作,揭示两个转录因子间的关系。 分析结果: 1、在对1913名B-ALL患者进行微阵列和转录组测序分析时,发现7.6%的患者具有描述的独特遗传谱,并揭示了在B-ALL中有一系列的分子事件涉及两个转录因子的相互作用。 2、ChIP测序发现转录因子基因DUX4的重排发生在所有B-ALL病例中,导致DUX4的高水平表达。DUX4结合到转录因子ERG的基因上,导致ERG的表达下调。ERG表达的下调通过缺失部分基因或通过另一种形式的ERG(ERGalt)的表达来损害ERG的功能,从而导致ERG转录因子的活性丧失,导致白血病。 3、DUX4的基因重排存在于所有具有不同基因表达谱的患者中,且DUX4的基因重排是在白血病发生的早期获得的克隆事件。 研究意义: 希望该研究的两个转录因子间的关系的确定可以导致新的诊断检测的产生。 |
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