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天将降大任于BCAR4

 微笑如酒 2018-12-20

小编最近阅读文献,发现一个很有意思的LncRNA——BCAR4,BCAR4也就是乳腺癌抗雌激素抗性4,是一种新型的长非编码RNA。它最初的功能是负责乳腺癌细胞中抗雌激素抗性的发展,并且在各种肿瘤中起重要作用


由于BCAR4在肿瘤中的临床诊断作用尚不完全清楚,所以作者打算攻克这个难题啊!于是作者筛选出了9项研究,其中包括1293名患者进行Meta分析(也叫做荟萃分析),研究BCAR4在许多癌症中作为预后生物标志物的潜在作用,评估BCAR4在不同类型癌症中的总体临床价值。结果主要分为五个方面:(1)人类癌症中BCAR4的表达与较差的总体存活率有显著的关联;(2)BCAR4的高表达与癌症患者的临床分期,远处转移和淋巴结转移都有关;(3)揭示了BCAR4在胃肠道恶性肿瘤,乳腺癌和骨肉瘤中的预后意义;(4)该荟萃分析表明BCAR4作为预测癌症患者预后不良的生物标志物的潜在价值。欲知详情,小编带你接着往下看↓↓↓

 


生物标志物一直都是生信相关研究的小网红,因为它有利于肿瘤预防和检测,长非编码RNA也就是lncRNA啦,是具有生物学价值的肿瘤生物标志物。小编通过在NCBI上查询,发现BCAR4位于16号染色体上并与乳腺癌转移有关,已有相关研究证实BCAR4是负责乳腺癌细胞中抗雌激素抗性发展的基因,而且BCAR4的表达在各种肿瘤组织中是有显著异常的。

作者使用Review Manager软件(有兴趣的小伙伴可以去找度娘问问)分析荟萃分析中提取的数据。基于卡方的Q检验和I2统计量用于确定异质性,判定标准为:如果所用研究存在异质性,则选择随机效应模型,假如没有严重的异质性时那就选择固定效应模型。最后,作者筛选出9项研究,包含1293名癌症患者样本纳入了荟萃分析中,该分析评估了6种不同类型的癌症,其中2例为乳腺癌,1例为非小细胞肺癌,1例为胃癌,2例为骨肉瘤,2例为结直肠癌,1例为宫颈癌。

 


BCAR4与预后之间有什么关联呢?小编通过比较发现,与BCAR4低表达组相比,BCAR4高表达组具有明显降低的总生存数,所以患有癌症和BCAR4高表达的患者可能导致较短的总生存数。

 


对于BCAR4表达与临床分期的相关性。这篇文章关于BCAR4表达与临床分期之间关系的分析包含4项研究,其中286例样本患有癌症。荟萃分析结果显示:BCAR4的高表达与不良临床分期之间存在巨大的关联。

 


除了临床分期,我们来看看BCAR4表达与远处转移和淋巴结转移的相关性。这个过程包含4项研究中的296名患者,这些样本用来检测BCAR4表达水平与远处转移之间的关系。结果显示,BCAR4表达上调与远处转移有关。此外,作者汇总了2项研究196名患者的风险比,发现肿瘤的淋巴结转移与BCAR4表达升高之间存在关联。这些结果都表明BCAR4的高表达可能与肿瘤转移相关。

 


在这里小编总结一下BCAR4在胃肠道恶性肿瘤,乳腺癌和骨肉瘤中的预后价值。根据BCAR4表达水平,3项研究记录了203名患有胃肠道恶性肿瘤患者的总生存数。结果显示BCAR4高表达与胃肠道恶性肿瘤的发生相关,此外,小编还发现BCAR4表达与乳腺癌和骨肉瘤患者的总生存数显著相关。

 


对于BCAR4在其他癌症类型中的表达。为了评估BCAR4在其他癌症类型中的表达水平,作者使用两个公共癌症数据库GEPIA和Oncomine来分析BCAR4在不同癌症类型中的表达,发现肿瘤组织中BCAR4的表达量高于相应的正常组织。

 


最后作者进行了敏感性分析来检测BCAR4和总生存数之间的关联。方法是从汇总分析中反过来剔除了每项研究,以检查移除的数据集对整体风险比的影响,结果发现每项研究的剔除不影响结果,表明综合分析的结果是可靠的

 

 

 

通过小编粗略地讲解,你是否对BCAR4有新的认识了呢?有兴趣的话,可以详细地阅读一下这篇文献噢!

参考文献

Long noncoding RNA Breast cancer antiestrogen resistance 4 is associated with cancer progression and its significant prognostic value 

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