|
2019年1月24日| Stephen Quake斯坦福实验室的研究人员正在使用单细胞RNA测序（scRNA-seq），以便深入了解食物过敏和引起它们的抗体。他们的研究结果最近发表在Science （DOI：10.1126 / science.aau2599）上。 该研究的重点是免疫球蛋白E（IgE）抗体的作用，该抗体在提供防寄生虫感染的同时，也是许多食物过敏的来源。 斯坦福大学博士候选人，该研究的合着者德里克克罗特告诉Bio-IT World ，他和Stephen Quake开始讨论像多年前一样的项目的可能性。scRNA-seq的应用令Croote着迷。 克罗特说，当研究人员针对IgE抗体时出现的一个问题是提出一种准确鉴定产生它们的细胞的方法。“这些细胞非常罕见，除此之外，还有其他细胞看起来像它们但不是。那么[scRNA-seq]允许你做的是高灵敏度捕获细胞而不必担心特异性。“ 克罗特说，这种方法需要一段时间才能开发出来。当涉及血液样本测试时，优化需要时间才能正确，并且将血液分解成单个细胞是一项挑战。 Croote和他的同事从6名患有严重食物过敏的儿童的血液中收集了尽可能多的IgE细胞，并且因为根据其单细胞分离了每种潜在的IgE抗体，他们能够以高灵敏度单独分析它们。根据已发表的论文，这使得该团队能够“表征每个细胞的基因表达，剪接变体，以及重链和轻链抗体序列”。 “这是一个重要的时刻，从一个充满挑战的过程充满了稀缺和模仿，并最终得到了许多细胞，然后我们能够找到IgE细胞，而不是真正关心其他细胞， “克罗特说。 在分离血样中的IgE抗体后，Croote和他的团队发现了具有高亲和力的交叉反应抗体。克罗特说，这可能是对食物过敏的反应可能比另一种反应更严重的原因。 “我们正在评估这是否会对一大群人有效，并确定这些抗体是否能抑制人工反应，”克罗特说。 在试管中设置人工反应可以让Quake实验室的研究人员采集释放组胺的细胞，引起过敏反应，并观察它们对某些蛋白质和抗体的反应，Croote说。 “我们可以采取这种通常具有诊断价值的测试，并将我们的抗体添加到鸡尾酒中，看看它们是否会抑制反应，”克罗特说。 使用scRNA-seq还可以深入了解人群对其他疾病的易感性。“对无关个体中高亲和力抗体的趋同进化的洞察可以指导疫苗设计并导致人群级被动免疫的策略; 它也是一个被认为是针对流感，艾滋病毒，肺炎链球菌等多种病原体而发生的过程，“克罗特和他的合着者在论文中写道。 更广泛的应用程序 虽然结果仍然很早，但克罗特说，有可能开发一种治疗来治疗实验室研究中的食物过敏症。根据克罗特的说法，Quake实验室已经提交了知识产权索赔。 “我们距离我们还有几年的时间，但是我们知道这种抗体可能会非常强烈地结合花生，然后对它们进行修改，”克罗特说。“因此，当我们将[这些抗体]重新引入人体时，它们仍会与花生结合，但不再有可能引起严重的过敏反应。” 他们并不是唯一一个希望开发食物过敏解决方案的人。AllerGenis和Luminex之间的合作关系 ，以及赛默飞世尔科技的发展，一直在推进食品过敏的新型诊断技术。 例如，赛默飞世尔科技的ImmunoCAP测试有助于预测患者是否可能对Ara h 6敏感，Ara h 6是花生中可能引起过敏反应的蛋白质成分。该测试还包括交叉反应性碳水化合物决定簇（CCD）和profilins的测定，其是包含在各种植物，花粉和食物中的过敏原。 “对花生过敏的高级诊断功能可以为过敏患者，尤其是幼儿带来更好的结果，”赛默飞世尔科技公司的一位代表在一份新闻稿中写道。 对于Croote来说，scRNA-seq是深入了解食物过敏性质的关键。为什么患者对花生过敏而不是树坚果，或者为什么他们对一些坚果而不是其他坚果过敏？ScRNA-seq的新功能使得Croote和Quake实验室能够找到这些问题的答案，因为它可以无偏见地捕获分泌IgE抗体的细胞。 “因此，例如，如果一个人对树坚果过敏，我们就会捕获B细胞，产生结合树坚果的IgE抗体，”克罗特在一次电子邮件采访中说。“然后我们可以对我们在论文中所做的过程进行类似的过程 - 我们可以针对一组树坚果测试每种抗体，以了解单克隆抗体结合与个体过敏的关系。” |
|
|
