不忘初心,继续前行。科研这条路,实如万里长征,有多少教授、医师兢兢业业坚守岗位,还不忘投身任重而道远的科学研究工作?今天小编为这路漫漫其修远兮的科研长征路带来了一个重磅好消息!look~ 图1 博奥晶典单细胞测序技术 日前,对新成员BD Rhapsody单细胞分析系统,博奥晶典已经完成平台搭建,并顺利完成全部测试,接下来,让小编带大家一起来检验这个平台神奇在哪里。 BD Rhapsody 系统由扫描仪和上样台两部分组成 基于10X的单细胞测序平台近两年在基础科研和临床医学研究领域大放异彩,但是对于不同的用户群和实验,开展单细胞实验往往需要不同程度的样本操作,质量和通量,这款BD仪器可以根据具体需求进行配置。BD Rhapsody由扫描仪和上样仪两部分组成:其中扫描仪提供自动化细胞计数和细胞活性测试,制备适用于卡式芯片最佳浓度的细胞悬液。扫描仪的配置改善了10X Genomics整个过程盲做的弊端,全程实时监测样品质量,实验结果有迹可循,在BD Rhapsody扫描仪中清晰成像,不满意随时终止实验。同时搭载轻巧便携的BD Rhapsody上样台,可在实验室内轻松移动。 图2 扫描仪+上样台 理论结合实践,测试实验马上开始 高通量群体单细胞测序往往非常昂贵,BD Rhapsody单细胞分析系统设计有多种功能,实现更有效的利用测序来降低实验成本。采用与10X相似的样品标签技术,捕获mRNA 的poly A尾,BD的单细胞捕获系统反应孔数量达到了22万个,细胞悬液由电子移液器注入孔注,自然沉降到U型孔中。包容性强,目前监测细胞通量在100—10000均可,整体环境温和,对于细胞活性要求低,仅需要达到50%即可轻松上样。细胞与Beads有效结合后,可当即开展后续实验,也可以在低温条件下保存cDNA长达16周;如此,研究者可根据实验设计按需定制方案,带给您群体高通量单细胞测序服务最佳的用户体验。 图3 同时标记细胞和mRNA分子的单个Bead概念图 俗话说“台上一分钟,台下十年功”,在正式实验开始前,实验负责人已经整理了几十页的实验操作SOP。本次测试从实验设计到单细胞悬液的制备以及整个实验过程中,实验操作人员敬业的精神,严谨细致的科研态度,让小编顿生钦佩感和自豪感。 图4 测试实验过程 实测数据结果展示 本着严谨求实的科研态度,此次测试我们选取了5例人外周血单核(PBMC)细胞样本,分别进行了:单样本单细胞实验,混合多样本的单细胞实验及平行对照组实验,数据分析的结果显示,5组实验的细胞平均捕获效率高达79%,为目前市场上所有主流单细胞测序平台最高。 小编从业以来,也算是见过各种大实验、新仪器的人,但是此次单细胞测试,为什么如此期待呢?答案即将揭晓!想不想通过一张照片看见数以万计的细胞真实状态呢?神奇的Rhapsody扫描仪,给您这个体验,放大有惊喜。 图5 混合多样本的单细胞实验Rhapsody扫描照片 上图一次loading了20000个单细胞到芯片,Rhapsody扫描出单细胞19535个,计算下来双细胞比率约6.5%,最终经数据分析处理,细胞分群结果如下: 图6 测试数据—细胞分群图 每一次推出新产品,都是整个团队星夜兼程,不懈努力的成果,艰难的摸索,优化开发的过程留给我们,愿给您最优质的服务,下面总结一下平台特色。 BD Rhapsody单细胞平台优势
至此,本次BD Rhapsody平台单细胞测试实验已经全部展示完毕,测试圆满,完结不是结束,而是新的开始,秉持每个博奥晶典人的精神”从芯出发,砥砺前行‘’欢迎每位感兴趣的老师按需前来,定制专属您的单细胞实验! 博奥晶典单细胞测序平台简介 博奥晶典作为国内第一家引进10X Genomics平台的公司,在国内率先开展上万级通量的单细胞转录组测序服务。目前已经完成了1000多个样品、50种不同样品类型的服务,覆盖的物种和样品类型包括人和小鼠的肝脏、肺脏、皮肤、心脏、脑、肾脏、血液、卵巢、神经,以及鸡、斑马鱼、猪、水稻、拟南芥、油菜、白菜、橄榄等,拥有丰富的项目经验。 此外,还在大规模单细胞转录组测序的数据挖掘上开发了很多新的流程,从样品制备到数据挖掘,为单细胞转录组测序研究提供一站式服务。博奥晶典支持10X Genomics单细胞转录组测序国内首篇科研论文发表在《PNAS》,并且目前为止该平台国内最高分科研论文发表在国际干细胞领域顶级期刊《Cell Stem Cell》。 博奥晶典于2018年9月与BD(中国)成立单细胞研究联合实验室,致力于大规模单细胞测序产品的开发和打磨,目前可开展以下单细胞测序产品的服务。 |
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