27分的circRNA文献，是怎么给安排的？

今天呢，想了很久，夏老师还是给你们讲讲文献吧（点上面的音乐，可以燃起来）。今天讲的这篇是发表在Nature Genetics（IF=27.125）上的一篇关于circRNA的文献：

大家应该都知道，circRNA是由可变剪切形成的环装的RNA：

嗯，这篇文献的主要内容呢，就是看一个circRNA如何结合启动子和Enhancer来促进这个STUP基因的表达。首先肯定是做二代测序，分析了一下circRNA和mRNA在肿瘤中的表达情况：

在高表达的基因中啊，他们通过circRNA序列与mRNA基因的启动子对比：分析出了一对组合，就是circRNA ApF和STUP这组，在表达上，这个circRNA与mRNA有着较高的相关性：

同样他们分析了一下STUP的基因序列，发现了基因后端，有一部分序列具有保守型：

在分析了整个STUP染色体结构拓扑异构后，有一个惊人的发现，就是在STUP基因后段的保守序列，有一段与启动子相结合的位置（蓝框里圈出来的）：

而这个位置正好是circRNA ApF结合的STUP启动子的区域，那么事情就明朗化了。

于是作者就提出了假设，是否是由于circRNA ApF结合的STUP启动子的区域及增强子区域，起到了增强STUP表达促进了肿瘤的形成？

当然首先是做表型的实验，他们先把circRNA ApF和STUP的相关序列使用CRISPR分别突变，检测表型的变化，发现确实突变后无法结合会导致肿瘤增殖受到抑制：

接着是一系列的RIP和RNA pulldown实验，来证明circRNA与STUP启动子以及增强子的结合关系：

最后大概就是这样的情况，circRNA通过与STUP启动子以及增强子的结合，促进了STUP基因的表达，促进了肿瘤的增殖表型：

看到这里是不是觉得已经初步了解了高分的circRNA的研究，都在做什么了吧？好了，要看这篇文献的话，就回复“circ”（不要在评论区回复），夏老师今天就给你们策到这里吧，祝你们心明眼亮。