| 共 56 篇文章 |
|
上海交大胥川团队研究表明97%以上环状RNA或源自分子错误！高通量测序发现很多基因都会产生环状RNA，比如人类有超过50%的蛋白编码基因都可以产生环状RNA，这证明环状RNA是广泛存在的；该研究团队认为，一系列证据表明环状RNA大部分源自于剪接错误，并估算出超过97%环状RNA是无用甚至有害的。(1)我们的结论是：环状RNA大部分来自于剪接错误，因此... 阅138 转0 评0 公众公开 21-10-08 11:37 |
第一类是以miRNA sponge为代表的，circRNA与miRNA 的相互作用是目前报道得最多的circRNA的功能模型，从近几年国自然中circRNA的获批中可以看出，获批的大多项目也是往miRNA sponge方向研究的，而最早提出miRNA sponge功能模型的是Max Delbruck柏林医学系统生物学研究所的RajewskyNikolaus教授。构建circRNA系列表达载体及制备特异性检测circRNA... 阅55 转6 评0 公众公开 19-10-05 21:14 |
circRNA领域10分+文章近期进展汇总：3篇article和1篇综述今天我们来汇总近期circRNA领域的高分文章研究进展，主要包括3篇10+article和1篇综述。circRNA产生的三种方式：Intron pairing-driven circularization，RBP-driven circularization和Lariat-driven circularization.研究circRNA的干实验和湿实验方法。circRNA检测的计算策略。检测和干... 阅117 转4 评0 公众公开 19-10-05 21:13 |
Read-through circRNA（rt-circRNA）是一类由两个基因的外显子组成的新型环状RNA，约占所有circRNA的2.5%，较一般的circRNA表达丰度更低，其形成与RNA聚合酶II在基因座位上的通读（Read-through）有关。在自身免疫性疾病系统性红斑狼疮（SLE）中可见circRNA减少和PKR异常活化，并且过表达circRNA能降低SLE患者外周血单核细胞（PBMC）中PKR的活... 阅125 转5 评0 公众公开 19-10-05 20:43 |
例如图2C中是由FLI1基因起源的circRNA FECR1能够和FLI1的promoter相互作用，并通过招募去甲基化酶TET1，使FLI1基因CpG岛区域产生广泛的去甲基化作用，同时circRNA FECR1可以结合于DNMT1基因的H3K27Ac富集的promoter区，进而反式抑制甲基转移酶DNMT1基因的表达。除此之外，circRNAs还可以调节其宿主基因的表达，如下图2A所示，circRNA的形成可以... 阅995 转12 评0 公众公开 19-09-29 13:13 |
环状RNA（circRNA）数据库大汇总，快来看看有没有你需要的！此外， 该数据库还可以用于设计环状 RNA 引物， 针对环状 RNA 的 siRNA。首个汇总编码蛋白环状 RNA 的数据库， 共收录了 32,914 个带注释的人类外显子 circRNA， 是一个完整的人类环状 RNA 分子数据库， 每条记录包含详细的基因组信息、 RNA 编辑情况、 IRES 序列元件、 预测的 ORF ... 阅4516 转55 评0 公众公开 19-04-27 09:15 |
circRNA领域10 文章近期进展汇总：3篇article和1篇综述今天我们来汇总近期circRNA领域的高分文章研究进展，主要包括3篇10+article和1篇综述。circRNA产生的三种方式：Intron pairing-driven circularization，RBP-driven circularization和Lariat-driven circularization.研究circRNA的干实验和湿实验方法。circRNA检测的计算策略。检测和干预c... 阅73 转2 评0 公众公开 19-04-27 09:14 |
在高表达的基因中啊，他们通过circRNA序列与mRNA基因的启动子对比：分析出了一对组合，就是circRNA ApF和STUP这组，在表达上，这个circRNA与mRNA有着较高的相关性：于是作者就提出了假设，是否是由于circRNA ApF结合的STUP启动子的区域及增强子区域，起到了增强STUP表达促进了肿瘤的形成？最后大概就是这样的情况，circRNA通过与STUP启动子以及... 阅123 转2 评0 公众公开 19-04-04 20:59 |
环状RNA作为ceRNA研究套路总结。microRNA能够通过与RNA序列上的结合位点结合从而导致功能RNA的沉默，反过来，具有相同microRNA结合位点的RNA分子能够竞争结合microRNA，从而实现两个RNA分子通过microRNA这个桥梁产生调控作用。作者利用CRISPR/Cas9分别删减HIPK3的内含子序列以及HIPK3的外显子序列，发现前者并不影响circHIPK3的表达，而后者则... 阅98 转3 评0 公众公开 19-04-03 16:47 |
测了2000多肿瘤样本的circRNA数据，怪不得发Cell！第一篇是关于肿瘤里面的circRNA全景图：The Landscape of Circular RNA in Cancer.Cell. 2019 Feb 7;176(4):869-881.e13.另外，研究团队还发现了一类circRNA：rt-circRNA（read-through circRNAs）从circRNA的表达丰度用于肿瘤分型等角度进行研究：另外，研究团队还挑选2000条表达丰度最高的ci... 阅66 转1 评0 公众公开 19-04-02 18:23 |
