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“生物记”——物种识别利器

 kibcat 2019-05-21

2019年5月20日星期一

生物记

目前,应用市场各种识别软件让人应接不暇,识花、懂鸟、昆虫鉴别等APP五花八门,公众想了解自然、认识物种,各种APP都得下载一个,功能还可能良莠不齐。那有木有集动植物各类生物识别鉴定功能为一体且简单好用的APP呢?由中科院先导A类专项“地球大数据科学工程”项目五BioONE支持建设的物种多样性信息平台开发的“生物记”解决了这一难题。

“生物记” 是一部生物百科全书,目前已经收录约3万多种中国生物的百科信息,包括中国鸟类、部分高等植物及真菌,后续将不断完善各个生物类群的百科知识;“生物记” 是一位AI小助手,能够利用定制语音输入功能准确记录1000多种鸟类中文名称(中文名称主要参考中国生物物种名录鸟类部分及《中国鸟类野外手册》)、常见生境类型及行为,自动化记录野外观测笔记;能够利用图像深度学习模型进行生物自动识别。目前除了中国鸟类识别,还可通过“花伴侣”接口识别植物识别。“生物记” 将持续专注动物物种识别及生物百科的建设,后续将提供更多动物类群的识别模型。

如何用“生物记”识别鸟类

 “生物记”的背后有庞大的数据支撑,如鸟类数据库有野外鸟类生态图片40多万张,分类学专家通过论证标注筛选,最终选出20万幅,可以确定中国鸟类绝大部分物种。只要用户提供的照片能看清鸟的眼睛,基本都能有效识别。

鸟类被拍到时在图像中占据的位置不一定靠近中心位置,且占据画幅的大小不一,有些小型鸟类在不放大情况下仅为一个点,很难识别。因此需要对图像进行裁剪,切取以鸟为中心适当大小的画面,这样可以大大提高识别准确率,同时减少网络流量。

相机拍照识别

目前生物记可以显示最相近的前6个鸟类识别结果及相应的百科和图片供用户参考。用户可以将识别结果分享到微信、微博等平台。如果用户不确定是哪个种类,可以点击“求高手鉴定”按钮,提交到“鉴别”模块,由其他用户及专家帮助鉴别。

如何用“生物记”识别植物

“生物记”开发者与花伴侣创始人李敏团队合作,接入“花伴侣”植物识别接口,提供植物识别服务。用户拍照后可选择植物识别,程序自动调用花伴侣进行识别。

如果您更关心植物类群,也可以直接扫码调用 “花伴侣” 小程序进行识别

如何使用“生物记”进行观察记录

记录观察笔记是野外观测活动的重要环节,也是后期数据整理的依据。目前,除了利用手机自动获取观测点的地理信息、时间信息外,“生物记”利用定制化语音识别针对鸟类名称进行建模,能够准确识别大部分鸟类中文名称,特别是很多鸟的名称都有生僻字,这极大地方便了野外考察者记录。后续将对该功能进行扩展到其他脊椎动物类群。

用户可以为观测到的每个物种上传图片,鼓励用户利用手机对物种的微生境进行拍照上传。“生物记”会利用手机的GPS功能,为每张图片定位,并显示在地图上。

技术负责人

林聪田

中国科学院动物研究所工程师;长期从事生物多样性信息学研究,关注如何用AI技术做生物自动识别,辅助科学研究。

后记

 当一位野外工作人员拍下一张照片时,他能随时通过平台去快速识别,并记录物种出现的时间、精确的位置及生存环境等信息。基于这些物种记录,并结合温度、降水、植被等数据,生态学家可以开展物种潜在分布区的预测,进行生物多样性评估与保护。

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