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初学者注意!miRNA才是科研套路之济世良方

 生物_医药_科研 2019-05-26

长久以来,我一直想写一篇关于miRNA的文章。我也与大部分医学科研工作者一样,在多个学术场合听到大咖小咖对于miRNA已经过时的论述,经过多维度研究比较,我蓦然发现,其实miRNA才是当之无愧的新手之友、从SCI灌水到跨越五分档次拿国自然基金无往而不利的科研利器。

单个变量代入五恒量,构成了最简单的疾病、表型加上分子的三要素课题。变量的分子类型很多,蛋白是经典,非编码RNA是当红趋势。非编码RNA中lncRNA、circRNA更有吸睛效应,为何miRNA还有独特优势?

1) miRNA是非编码RNA,在做“表达差异”的环节不需要进行蛋白水平的检测,不用买抗体做Western,仅qPCR检测RNA水平即可,简化了工作量。

2) 在执行“一正一反”的Gain / Loss of function过程中,miRNA的过表达和沉默都只需要订购短片段合成RNA,价格低廉且到货周期快。同时对于大部分细胞而言,用脂质体转染法可实现高效导入miRNA mimics或inhibitor到靶细胞,实验操作简单,易于重复。

由此可见,在低分灌水阶段(单变量研究,不做机制),miRNA的成文效率比做蛋白和lncRNA / circRNA高。

而在明确主变量、寻找相互作用的靶基因过程中,都需要走数据库预测或者实验筛选的流程,RNA和蛋白相互作用或者蛋白与蛋白相互作用预测的准确度不能说特别高,所以很多研究者会直接进行实验筛选,放弃预测环节。

miRNA的靶基因预测可以说是其中准确率最高的作用形式,只需要在几个数据库中输入miRNA名称,即可输出预测靶基因结果,将多个数据库的预测结果取交集,再结合细胞株中过表达miRNA之后,这些靶基因是否具有下调趋势的结果,即可锁定一组直接作用分子,Luciferase Assay验证成功,即大功告成。

因此,对于miRNA研究来说有2个难点,一个是Luciferase Assay,靠你们自己突破,另一个是如何预测miRNA靶基因或者已知基因反向推测调控的miRNA,需要用到一些数据库,这些数据库虽然操作简单,但总有学员感觉难以突破。

学员的需求就是老师的价值,现在有了miRNA靶基因数据库精品小课,从此世间不再有难做的miRNA靶基因机制。有兴趣的同学可直接扫码购买,限时只要9块9。

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