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两个陆桥，神秘的先驱者：现代人来到美洲
在欧洲对美洲进行殖民统治的早期阶段，人们意识到美洲的原住民与东亚人在体貌特征上存在着很多相似之处，例如眼睛的形状和头发的样式。这些相似之处已经被精细到牙齿形状和DNA的人类学研究所证实。但是这些新移民是什么时候又是从哪里到达美洲的呢？这样的不同迁徙又有多少次呢？我们通常假设，第一批移民是在海平面很低的时候横穿西伯利亚和阿拉斯加之间的白令海峡到达的美洲。他们可能只是跟随迁徙的驯鹿群穿过了裸露的白令陆桥，不过也可能是乘小舟沿岛链从南边的海上到达北美。他们的到来为人类开启了一个全新的世界，这片幅员辽阔的土地几乎拥有地球上的任何一种气候与环境和特有的动植物。
通常认为，以克洛维斯文化（Clovis）为代表的第一批美洲人是在13000年或12000年之前到达美洲的。从此以后，有许多曾经遍布美洲的大型哺乳动物灭绝了，例如大象、野马、骆驼和地懒，学界普遍认为人类的捕杀是这些动物灭绝的主要原因。然而，有一些科学家持不同意见，他们认为气候和环境的变化，甚至是疾病的影响对动物灭绝所起的作用都要大于人类的捕杀。此外，还有来自梅多克罗夫特岩棚和蒙特沃德越来越多的证据也表明了这一观点。
在南美的一些和克洛维斯同一时期的考古遗址表明，那一时期的美洲人已经有了文化差别，所以人们应该在更早之前就已经进入了美洲。另外，在智利南部一个叫蒙特沃德（Monte Verde）的地方，也发现了大约距今14500年有人类居住的证据。考古学家们认为，新移民们穿越白令海峡进入阿拉斯加的迁徙高峰出现在距今大约20000年的最后一次冰河时期，否则，他们不会有如此充足的时间去迁徙如此长距离。的确，一些科学家认为，这一迁徙高峰可能早在3万年前就已经出现了。新移民可能在18000年前迅速地向美洲的西海岸迁徙，而后进入内陆。
美洲早期居民的人种具有多样性，他们与现在的美洲原住民并不十分相似，全美洲发现的各地距今9000多年的人类化石为这一结论提供了新的证据。他们包括，在美国境内的距今9000年其所有权仍有争议的肯纳威克人（Kennewick Man，华盛顿州）的骨架，以及距今10000多年灵山洞（Spirit Cave，内华达州）的一部分干尸骨架，同时发现的还有一部分织物和编织的篮筐。再往南部走，在墨西哥城发现的一具女性的骨架距今已超过12500年，而另一具在巴西的米纳斯吉拉斯州的一个山洞中发现的女性头骨距今大约10500年。这具女性头骨狭长而面部低平，这与现代的美洲人有很大的区别。近期有研究表明，这种独特的人种在最近的几百年中，可能在偏远的地区得以幸存，例如墨西哥的巴哈半岛。因此有可能，美洲的第一批移民来自亚洲不同的族群，而后他们被现代美洲人真正的祖先所取代。然而正如我们所看到的那样，世界各地的早期的现代人化石与现在的本地人类并不十分相似，即便到了10000年前，各个种族之间的特征还在继续分化着，所以，早期人类迁徙中的多样性问题，依然悬而未决。
研究美洲原住民的起源拥有大量的基因数据支持。其中有很多来自东亚的样本以及一些古DNA数据，将这些样本与现代美洲人mtDNA进行比较，可以研究其内部的关联性。迄今为止的研究结果显示，整个美洲地区的基因突变率都相当低。其中四条主要的mtDNA支系很可能来自美洲的新移民（即今天印第安人的祖先），而这又能与现在西伯利亚南部地区的人们相联系。
与此同时，在北美也发现了一个被称为“X”的支系，这个支系现在存在于亚洲和欧洲。因此一些科学家相信，这一结论支持了一种完全不同的美洲新移民的迁徙路线——直接从欧洲乘船沿着当时冰冻的北大西洋冰盖边缘穿越大海到达美洲！这一结论主要依据是美洲的克洛维斯文化的矛头与西欧旧石器时代梭鲁特文化之间存在的相似之处。然而多数专家认为，这种相似只是一种巧合，这种X型的mtDNA 同样很有可能是从亚洲传入到北美的。Y染色体分析至今为止都是支持美洲原住民的亚洲起源的，但是父系Y染色体的共祖时间却要比母系线粒体的年轻得多。
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