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2015年10月，北京协和医院神经科关鸿志教授团队在《Journal of Neurovirology》在线发表了国内第一篇脑脊液mNGS临床应用文章，2016年12月关教授牵头脑炎协作组进一步探索脑脊液mNGS在协助中枢神经系统感染诊断方面的应用，先后多篇文章发表，同时国内其他专家学者相关领域的文章也陆续发表。 （注：文献顺序按照由远及近的时间进行推送） Detection of virus in CSF from the cases with meningoencephalitis by next-generation sequencing 脑脊液mNGS诊断病毒性脑膜脑炎感染病原 Journal of Neurovirology [IF=3.228] 1）由于中枢神经系统感染时病原种类多样、标准化检测方法有限，传统的脑脊液检测诊断病毒较为困难，数据显示目前约60%的脑炎脑膜炎病因不明； 2）对4例疑似病毒性脑膜脑炎患者的脑脊液进行mNGS检测，检出2例HSV1、1例HSV2和1例VZV，检出的病毒特异性序列数从144到44,205不等，基因组覆盖度范围从12%到98%，其中3例病人的mNGS结果通过PCR进一步得到验证，4例病人的临床表现和治疗结果均与mNGS诊断结果一致； 3）mNGS检测感染病原体不需要先验的临床信息，可报告结果快速准确，极大缩短了感染病原诊断时间，研究显示mNGS不仅可以用于病原体鉴定，还可进一步用于耐药基因和毒力因子检测； 4）随着检测平台不断完善和成本不断下降，mNGS将会对传统的感染诊疗方式产生重大的影响。 Guan Hongzhi,Shen Ao,Lv Xia et al. Detection of virus in CSF from the cases with meningoencephalitis by next-generation sequencing.[J] .J. Neurovirol., 2016, 22: 240-5. Detection of Listeria monocytogenes in CSF from Three Patients with Meningoencephalitis by Next-Generation Sequencing 3例脑膜脑炎患者通过脑脊液mNGS检出单核细胞增生李斯特菌 Journal of Clinical Neurology [IF=2.851] 1)李斯特菌脑炎较为罕见，但致死率非常高，通过常规脑脊液检测进行早期诊断较为困难； 2）3例诊断为急性/亚急性脑膜脑炎的患者，其磁共振成像、血培养和经验性用药等指向单核细胞增生李斯特菌感染，但脑脊液培养结果均为阴性； 3)使用mNGS对脑脊液标本进行检测，三个病例均检测出单核细胞增生李斯特菌，检出的细菌特异性序列数从74到665不等，基因组覆盖度从0.28%到2.40%，其中2例mNGS结果通过PCR得到进一步验证； 4）该研究为第一次应用脑脊液mNGS辅助诊断中枢神经系统单核细胞增生李斯特菌感染； 5）作者提出如果mNGS技术在临床微生物学中常规应用，可能将显著改善中枢神经系统感染性疾病的诊断方法。 Yao Ming,Zhou Jiali,Zhu Yicheng et al. Detection of Listeria monocytogenes in CSF from Three Patients with Meningoencephalitis by Next-Generation Sequencing.[J] .J Clin Neurol, 2016, 12: 446-451. Next generation sequencing of the cerebrospinal fluid in the diagnosis of neurobrucellosis mNGS协助快速精准诊断布氏杆菌脑膜炎 International Journal of Infecious Disaeases [IF=3.538] 1）布鲁氏菌病是由布氏杆菌引起的全世界常见的人畜共患传染病，由于其临床症状不典型，传统培养阳性率低，布氏杆菌的诊断比较困难； 2）4例怀疑布鲁氏菌病的患者均来自疫区，但无明确的布氏杆菌流行病学接触史，临床症状表现不一，脑脊液mNGS均快速检出布氏杆菌，检出特异性序列数从11到104不等，基因组覆盖度从0.0043%到0.4%，其中3例mNGS结果得到PCR的进一步验证，且mNGS快速明确诊断病原体后促进了临床及时的针对性抗生素治疗； 3）背景微生物的污染是mNGS技术面临的常见问题，可以通过阴性质控进行部分排除，但需要临床熟悉常见背景菌同时结合临床实践更好的解读结果； 4）mNGS报告结果快速，可以能够推动临床及时调整治疗，由于目前mNGS检测的可及性还较为局限，主要适用于疑难感染诊断； 5）该研究结果显示mNGS可以有效地协助诊断布鲁氏菌病。 Fan S , Ren H , Wei Y , et al. Next-generation sequencing of the cerebrospinal fluid in the diagnosis of neurobrucellosis.[J]. International Journal of Infectious Diseases, 2018, 67(C):20-24. Next-Generation Sequencing of Cerebrospinal Fluid for the Diagnosis of Neurocysticercosis 脑脊液mNGS协助确诊脑囊虫病 Frontiers in Neurology [IF=2.635] 1）脑囊虫病是常见的中枢神经系统寄生虫感染性疾病，由于其临床表现差异很大、影像学和血清学敏感性和特异性有限，目前脑囊虫病的诊断较为困难； 2）4例患者以脑膜受累为主，临床表现为头痛、脑膜刺激征或者脑积水等，伴有脑脊液白细胞升高与糖减低，临床高度怀疑中枢神经系统感染但未明确病原,其中病例1和病例3从症状出现到最终明确诊断为脑囊虫病分别花费了5年和8年的时间； 3）使用mNGS对4例患者的脑脊液标本进行检测，均检测到猪带绦虫，特异性序列数从478到9,491不等，基因组覆盖度从0.06%到1.15%，远高于背景菌序列数，而其它的质控样本中均未检出猪带绦虫片段； 4）4例患者的血清和脑脊液中的猪囊尾蚴IgG抗体阳性进一步验证了mNGS结果； 5）作者提出由于目前送检渠道的可及性，脑脊液mNGS可能有助于不同地区疑难感染性脑炎诊断水平的均质化； 6）病例结果提示脑脊液mNGS在协助诊断疑难脑囊虫病方面具有良好的应用前景，需要大规模的研究进行进一步探讨。 Siyuan F , Xiaodong Q , Lei L , et al. Next-Generation Sequencing of Cerebrospinal Fluid for the Diagnosis of Neurocysticercosis[J]. Frontiers in Neurology, 2018, 9:471-. 敬请期待 后续，我们还会继续解读至今为止中国学者在脑脊液mNGS领域优秀的研究成果，敬请期待。 |
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