FANTOM全称如下
是一项国际性的研究项目,创建于2000年,最初的目的是对小鼠全长cDNA序列进行功能注释。随着不断发展,研究的内容在也在转录组学层面不断拓展。 在该项目的第三个阶段,采用了CAGE-seq这一技术手段来准确研究不同转录本的转录起始位点
除了常规的蛋白编码基因和转录调控外,该项目还在lncRNA, miRNA等非编码RNA,即ncRNA领域进行了研究。相关结果和数据面向全世界开放的,可以在官网下载得到。 今天要介绍的是从该项目中得到的增强子数据,网址如下
通过 检索结果分成了两个部分,在页面左侧可以看到增强子的基因组位置,可以下载 在页面右侧,给出了增强子的表达水平,分成了以下3个层次
对应不同细胞,器官,样本中的表达水平,以细胞水平的表达情况为例,示意如下 通过 通过以上网址,可以对增强子进行在线查找和分析。对于所有增强子的信息,可以通过以下链接进行下载 提供了 ·end· |
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