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今天是第1325期日报。 上海交大医学院：增强口服活菌疗法效果的新方法Nature Communications[IF:11.878] ① 在Ca+和胆固醇帮助下，通过涡旋可快速将二油酰基磷脂酸覆盖到大肠杆菌Nissle 1917菌株（EcN）表面，形成自组装脂膜包被的细菌（LCB），该方法也适用其它形态的细菌；② 正常培养时，LCB的生长及活力与EcN无差异，但在强酸、强碱、高浓度乙醇和胆盐、人工胃液和肠液条件下具有更高的存活率；③ LCB在小鼠肠道的保留时间和存活率显著高于未包被的EcN；④ LCB在预防和治疗鼠伤寒沙门氏菌和DSS诱导的小鼠结肠炎方面明显优于EcN。 Biointerfacial self-assembly generates lipid membrane coated bacteria for enhanced oral delivery and treatment 【主编评语】口服活菌改善肠道微生态的疗法，受限于活菌在消化道内的低存活率。上海交大医学院附属仁济医院、上海市肿瘤研究所刘尽尧团队，近期在Nature Communications报道了一种方法，可快速制备被脂膜包被的细菌，能大大增强细菌在消化道内的存活和存留，并以大肠杆菌Nissle 1917菌株为例，表明这一技术可提高这种益生菌防治小鼠结肠炎的效果。（@mildbreeze） Cell子刊：肠道罗斯拜瑞氏菌可改善小鼠酒精性脂肪肝Cell Host and Microbe[IF:15.753] ① 纳入212名双胞胎，发现酒精可导致肠道菌群失调，罗斯拜瑞氏属丰度降低；② 肠道罗斯拜瑞氏菌（R. intestinalis）能改善小鼠酒精性脂肪肝（ALD），降低与肝脏炎症、脂质转运相关基因的表达，死菌也有效；③ R. intestinalis鞭毛蛋白或可通过识别TLR5，上调紧密连接蛋白Occludin和粘蛋白MUC2基因，保护肠屏障，并上调IL-22和REG3γ基因；④ R. intestinalis干预ALD小鼠，可改善肠道菌群；⑤ R. intestinalis含糖苷水解酶，能恢复多糖代谢功能。 Roseburia Spp. Abundance Associates with Alcohol Consumption in Humans and Its Administration Ameliorates Alcoholic Fatty Liver in Mice 【主编评语】目前认为肠道菌与酒精肝的发生有关，但是，对究竟哪些细菌的变化会引起酒精性脂肪肝，及这些细菌的功能是什么，相关的研究都还不够充分。Cell Host and Microbe最近发表的研究，招募了212名双胞胎，在考虑宿主基因和其他潜在混杂因素的基础上，分析了饮酒（酒精摄入）对肠道菌群的影响，结果发现酒精可导致肠道菌群失调，罗斯拜瑞氏属丰度降低，肠杆菌科增多。用肠道罗斯拜瑞氏菌（R. intestinalis）干预酒精性脂肪肝小鼠，能改善小鼠酒精性脂肝，增强肠屏障。本研究结果或可用于开发治疗酒精性脂肝的微生物疗法。（@nana） 仁济医院团队：表皮葡萄球菌促进鼻菌群的健康成熟Cell Host and Microbe[IF:15.753] ① 对比分析儿童、年轻人及老年人的鼻菌群组成，发现在人鼻菌群成熟期间，莫拉克斯氏菌属等致病菌显著减少，而表皮葡萄球菌显著增加；② 在老年人中，鼻菌群的上述变化趋势有所逆转，表皮葡萄球菌减少而致病菌增加；③ 在体外，表皮葡萄球菌可刺激鼻上皮细胞产生抗菌肽（包括hBD3及LL37），以减少致病菌数量；④ 表皮葡萄球菌可形成生物膜，以保护其自身免受抗菌肽影响； Staphylococcus epidermidis Contributes to Healthy Maturation of the Nasal Microbiome by Stimulating Antimicrobial Peptide Production 【主编评语】来自上海交通大学医学院附属仁济医院的李敏团队与国外团队合作在Cell Host and Microbe上发表的一项最新研究，发现在鼻菌群成熟期间，表皮葡萄球菌通过刺激鼻上皮细胞产生抗菌肽杀伤致病菌，并通过形成生物膜抵抗抗菌肽的杀伤作用，从而促进鼻菌群的健康成熟。（@szx） 广东海洋大学团队：家猪的宿主-肠道菌群互作（综述）Gut Microbes[IF:7.823] ① 猪肠道菌群在调控消化道健康、代谢稳态以及生理、神经和免疫功能中有重要作用；② 动物的年龄、出生方式、品种和遗传、饮食因素（膳食纤维、铜含量、益生菌、益生元等）、抗生素使用、应激源（如断奶、感染和炎症等）以及周围环境，都可能影响猪的肠道菌群；③ 肠道菌群可影响猪的肠道和系统性免疫，在菌群与宿主的互作中，肠碱性磷酸酶（IAP）和诱导型热休克蛋白（iHSP）可调控抗氧化和抗炎症反应，对消化道上皮起保护作用。 Interactions between host and gut microbiota in domestic pigs: a review 【主编评语】猪不仅是重要的养殖动物，也是研究菌群-宿主互作的模式生物。Gut Microbes近期发表了来自广东海洋大学团队的综述，回顾了家猪相关的肠道菌群与宿主互作的研究进展。（@mildbreeze） 王松灵+陈峰：硝酸盐通过调控肠道菌群缓解小鼠结肠炎Free Radical Biology and Medicine[IF:5.657] ① 小鼠分为4组：对照、DSS诱导结肠炎、DSS+NaCl处理、DSS+NaNO3处理；② NaNO3可缓解DSS诱导的小鼠结肠炎，增加结肠长度，维持体重，减少结肠上皮细胞的凋亡，减少结肠及外周血中的炎症细胞浸润；③ DSS处理可导致小鼠肠道菌群失调，NaNO3处理可恢复乳杆菌属等有益细菌，增加Gordonibacter等分类群；④ DSS处理可导致p53信号通路、结直肠癌相关通路等代谢通路的富集，NaNO3处理可降低这些通路。 Nitrate ameliorates dextran sodium sulfate-induced colitis by regulating the homeostasis of the intestinal microbiota 【主编评语】来自首都医科大学附属北京口腔医院的王松灵团队与北京大学口腔医院的陈峰团队在Free Radical Biology and Medicine上发表的一项最新研究，发现在DSS诱导的小鼠结肠炎模型中，硝酸盐可缓解结肠炎症，并调节肠道菌群的组成与功能，提示硝酸盐或可用于未来的IBD治疗。（@szx） 南开大学团队：中国人群的肠道抗性组及抗生素残留Science of the Total Environment[IF:5.589] ① 在61名患者及73名健康人的粪便中共检测到111个抗生素抗性基因（ARG）和7个可移动遗传元件（MGE）；② ARG的主要作用机制包括：导致抗生素失活、细胞保护及外排泵；③ 与健康人相比，患者肠道抗性组及菌群的多样性较低，而抗生素ARG浓度较高；④ 抗生素含量与ARG的总丰度正相关，与ARG及菌群的多样性负相关；⑤ 高丰度的cfxA基因（β内酰胺类抗生素耐药基因）可作为抗生素使用的生物标记；⑥ 人肠道中的兽用抗生素可能从饮食中获得。 Gut resistomes, microbiota and antibiotic residues in Chinese patients undergoing antibiotic administration and healthy individuals 【主编评语】来自南开大学的罗义和毛大庆与团队在Science of the Total Environment上发表的一项最新研究，从中国3个省份收集上百份粪便样本，对比分析了健康人（6个月内未接受过抗生素治疗）及患者（1个月内接受过抗生素治疗）的肠道抗性组、菌群、及抗生素残留情况，发现近期使用抗生素可降低肠道菌群多样性，增加肠道中的抗生素耐药基因水平。（@szx） 饮食成分可经真菌促进特定肠道细菌定植NPJ Biofilms and Microbiomes[IF:6.333] ① 日本人动物产品摄入较多，肠道菌群中拟杆菌丰度更高，而印度人摄入更多的植物多糖，普雷沃氏菌和念珠菌丰度更高；② 念珠菌在体外对植物多糖阿拉基木聚糖（AX）具有强烈的生长反应；③ 含有AX的念珠菌生长培养基上清液，促进粪便普雷沃氏菌（P. copri）快速增殖，其中的阿拉伯糖是潜在的促生长因子；④ 念珠菌对木糖具有生长反应，对阿拉伯糖则没有，而P. copri对木糖和阿拉伯糖皆有生长反应；⑤ 无菌小鼠经念珠菌定殖后，可促进P. copri定殖。 Comparison of Japanese and Indian intestinal microbiota shows diet-dependent interaction between bacteria and fungi 【主编评语】肠道菌群中存在微生物的跨界互作，NPJ Biofilms and Microbiomes发表的一项研究报道了这样一个具体例子。该研究通过对比不同饮食偏好的日本人和印度人的肠道菌群，结合体外和动物实验，表明肠道真菌念珠菌可促进肠道共生细菌——粪便普雷沃氏菌的定植和生长，这种真菌-细菌互作中，特定膳食多糖成分可能有关键介导作用。（@mildbreeze） Nature子刊：建立微生物组中心，为微生物组科学发声Nature Microbiology[IF:14.3] ① 微生物组中心的首要任务是通过促进合作、支持新项目和提供实验室和分析服务，加速微生物组研究，也为校园和社区服务；② 为欲从事微生物组研究的人员提供培训、对微生物组研究方法的需要、资金资助，促进了微生物组中心的出现；③ 多个中心形成微生物组中心联盟（MCC），利于跨学科合作、制定行业标准、提供平台等；④ 多数中心由短期内部资金支持，依赖教职工自愿贡献时间，MCC或可通过扩大资助范围、发展慈善和行业伙伴关系等解决此问题。 The emergence of microbiome centres 【主编评语】Nature Microbiology最近发表的评论文章，从微生物组中心的任务及作用、出现的原因、面临的问题及解决方法等方面进行了阐述，意在说明微生物组中心的建立旨在共享战略和加速知识转移，为微生物组科学发声。（@nana） 感谢本期日报的创作者：EADGBE，王文东，szx，宋云皓，Echo Quasimodo |
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