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作者：小哈 来源：嘉因 在同一套RNA-seq，为什么公司做的跟师兄跑的结果不一样？ | TPM、read counts、RPKM/FPKM你选对了吗？一文，聊了怎样做RNA-seq数据预处理：把samples拉到同一起跑线。 今天讲差异基因筛选，继续搬statQuest视频，点击左下角“阅读原文”直达代码页。文末附第一个视频中提到的P-value和FDR视频，和阈值设定的comment音频。 有些基因read counts数非常低，一个两个reads不可信，DESeq2和edgeR有各自的处理方法。 上面视频中提到的P value和FDR视频： P value FDR，结合RNA-seq讲的很清楚，筛差异基因、功能富集分析，都要用到FDR。 最后作者出镜答疑，阈值设定有啥讲究，0.05？ |
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