本来以为是写了:【紧急通知】下载R包却联网失败?初学者的痛,大家应该是不再发邮件咨询我R包安装问题,没想到的是碰到了R包各大镜像纷纷宕机! 镜像站点故障这个对初学者来说,的确很难理解,如果你参加学习班的话,就有讲师和助教团队协助解决了(感兴趣的可以点击下面两个课程)不过绝大部分(99.99%)的粉丝无缘我们学习班,我只能是通过公众号的方式告知大家这个解决方案了。如果安装R包失败,提示Warning: unable to access index for repository …cannot open URL….请尝试这种方法:options(BioC_mirror="http://mirrors.tuna./bioconductor/") options("repos" = c(CRAN="http://mirrors.tuna./CRAN/")) BiocManager::install("包") install.packages('包')
可以看到,主要的修改方式,在于镜像地点,还有https和http协议切换。 关于R镜像列表R 语言在中国区的镜像不多,大家可以在 https://cran./mirrors.html 查询,列表如下: https://mirrors.tuna./CRAN/ TUNA Team, Tsinghua University https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/ University of Science and Technology of China https://mirror-hk.koddos.net/CRAN/ KoDDoS in Hong Kong https://mirrors.e-ducation.cn/CRAN/ Elite Education https://mirror.lzu.edu.cn/CRAN/ Lanzhou University Open Source Society https://mirrors.tongji.edu.cn/CRAN/ Tongji University
如果失败,或者网速不好,就替换一下即可。 options()$repos options()$BioC_mirror
替换后进行简单的检查! 关于https和http协议纯粹是增加我们的认知负担,不建议大家去学习了,如果你感兴趣,可以看:Windows电脑使用Rstudio会有多少错误呢 ,下面的两个代码也会对你有帮助 options(download.file.method = 'libcurl') options(url.method='libcurl')
还有就是,不要害怕这样的代码,运行前后看看效果就好了,重启R这些设置都会失效,不会对你电脑造成永久性损伤! 更无语的是还有一些人使用bioclite在安装R包今早就接到一个四年前的微信好友,也许是生信菜鸟团qq群认识的, 问出R包安装的问题
真的是很过分了,这些年我写了1.3万篇教程,约10%都是R相关的,关于r全套资料我早就分享完毕了: 很多朋友之所以学习R语言其实就是为了重复一些简单的数据库挖掘文章,所以我也顺便录制了GEO数据库挖掘课程,代码在:https://github.com/jmzeng1314/geo,如果你网络很差,就下载打包版本的geo代码,https://share./5vrfsqv 并且一定要做作业,比如https://mp.weixin.qq.com/s/4VP8fK5rTRW9aiJwYFxzNw 配套教学视频在B站:https://www.bilibili.com/video/av26731585/ 还有一个公共数据库挖掘:https://www.bilibili.com/video/av37568990 视频应该是都在:https://www.bilibili.com/video/av25643438/ 如果是需要安装R包,请务必参考:http://www./3727.html 代码 专门为R语言建立了 GitHub 仓库存放相关学习路线指导资料:https://github.com/jmzeng1314/R_bilibili 文末友情宣传 强烈建议你推荐我们生信技能树给身边的博士后以及年轻生物学PI,帮助他们多一点数据认知,让科研更上一个台阶:
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