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【AACR 2020】世和篇章I:超大样本分析看肺癌“罕见”突变对“常见”治疗方式的响应与提示

 生物_医药_科研 2020-04-27

(图片来自AACR官网)

美国癌症研究协会(AACR)是世界上创立最早、规模最大的专业癌症研究协会,致力于癌症基础科学与临床研究。受疫情影响,2020 AACR年会即将于4月27-28日和6月22-24日采取线上会议形式举办。世和基因连续6年参与AACR、ASCO、ESMO和WCLC等国际大型会议,迄今已中稿近80项研究成果。本届AACR年会,世和基因共中稿10篇壁报,壁报内容将分为3个篇章,与AACR年会同期发布。

篇章I:超大样本分析看肺癌“罕见”突变对“常见”治疗方式的响应与提示
篇章II:NGS检测新思路开启MSI、BRCA检测新体验
篇章III:分子层面探秘肿瘤的演化过程


2020 AACR 世和研究成果展示 篇章I


MET、ROS1、FGFR等罕见驱动基因突变发生率较低,因此针对携带罕见突变的患者群体进行研究较为困难,许多罕见突变对靶向药物的响应和耐药机制目前尚不清楚。通过基于NGS技术的大Panel检测,进行更全面的基因突变图谱研究和药物疗效监测,有助于探索更多的罕见靶点和耐药机制,优化精准治疗方案,为患者带来更多治疗机会。接下来小编通过以下3篇超大样本研究的Poster,带大家来看一看肺癌“罕见”突变对“常见”治疗方式的响应与提示。



1

Genomic and clinical characteristics of MET exon14 alterations in 26,391 Chinese cancer patients

Poster摘要号:3537

研究团队:世和基因科研团队

成果亮点:继发MET突变和BRAF p.K601E突变可能是克唑替尼耐药新机制

MET基因14外显子(METex14)及其两侧内含子区域的基因变异,可引起MET激活,进而导致肿瘤发生。研究表明,携带METex14突变的患者通常能够从克唑替尼等药物中获益。

本研究回顾性分析了6,391名中国肿瘤患者METex14突变情况及克唑替尼治疗的疗效。整体人群METex14突变发生率约为0.7%(184/6391),其中肺癌患者METex14突变发生率约为1.1%(175/1591),低于西方人群的发生率(3-7%)。本研究检测到78种METex14突变,主要突变类型为剪切位点的碱基替换(42%)和13内含子的插入/缺失突变(28%)。非14外显子MET突变发生率为11%,MET扩增发生率为4%。接受克唑替尼治疗的14例患者,mPFS为7个月,最长PFS为17个月。克唑替尼耐药的患者中,2例患者继发MET突变,1例患者继发BRAF p.K601E突变,提示可能是克唑替尼耐药新机制。



结论


MET基因14外显子突变在中西方人群中发生率存在差异,其主要突变类型为剪切位点的碱基替换和13内含子的插入/缺失突变,继发MET突变和BRAF p.K601E突变可能是克唑替尼耐药新机制。


2

Molecular and clinicopathological characteristics of Chinese non-small cell lung cancers with ROS1 gene fusions identified by next-generation sequencing

Poster摘要号:4577

研究团队:郑州大学第一附属医院李文才教授和姜国忠教授团队

成果亮点:非CD74-ROS1融合的患者克唑替尼治疗可能获益更多

ROS1基因融合发生率为1-2%,目前已经确定的ROS1融合的伴侣基因约20种。克唑替尼等药物对携带ROS1融合的NSCLC患者有较好的疗效。

本研究对17,158例中国NSCLC患者肿瘤标本和/或cfDNA进行NGS分析,同时评估了其中37例接受克唑替尼治疗的患者的PFS。ROS1阳性NSCLC患者约为1.7%(288/17158),其中ROS1融合的发生率为89.6%(258/288),最常见的伴侣基因是CD74(40%),其他常见伴侣基因包括:EZR、SDC4、SLC34A2、TMP3等。ROS1融合的主要断裂点发生在31-34内含子区(约90%),且没有明显的热点。另外,5.4%的ROS1融合发生在基因间隔区域(IGR),主要位于ROS1的同一染色体上,融合产物未知。37例接受克唑替尼治疗的患者中,ROS1融合发生在31-34内含子区的患者mPFS无显著差异,而非CD74-ROS1融合的患者(n=23)比CD74-ROS1融合的患者倾向于有更长的mPFS。11例克唑替尼耐药的患者检测到ROS1 G2032R和S1986F耐药突变。此外,三分之二携带不明特征融合伴侣(IGR-ROS1)的患者可以从克唑替尼治疗中持久受益。



结论


超万例样本NGS检测显示中国NSCLC患者ROS1突变发生率为1.7%,主要突变类型为融合突变,发生率为89.6%。ROS1融合常见伴侣基因包括CD74、EZR、SDC4和SLC34A2等。非CD74-ROS1融合的患者比CD74-ROS1融合的患者对克唑替尼治疗可能获益更多。


3

Landscape of FGFR activating aberrations in Chinese non-small cell lung cancer

Poster摘要号:4653

研究团队:哈尔滨医科大学附属第二医院杨宇教授、上海胸科医院周箴教授、安徽医科大学第二附属医院刘红艳教授、广州医科大学附属肿瘤医院柳子川教授

成果亮点:FGFR融合可能是EGFR-TKIs继发耐药机制之一

成纤维细胞生长因子受体(FGFR)信号功能异常在NSCLC中,尤其是肺鳞癌中较为常见。

本研究采用NGS检测,回顾性分析了10,966例NSCLC患者的肿瘤标本和/或cfDNA的突变特征。约1.9%(210/10,966)的NSCLC患者检测到FGFR基因突变,突变类型包括点突变、融合和扩增,并且FGFR致癌突变中的点突变、融合和扩增互相排斥。肺鳞癌中FGFR突变发生率为6.8%(65/954),显著高于肺腺癌(1.3%)。约0.11%的患者检测到了保留完整激酶结构域的FGFR融合,包括9例FGFR3-TACC3融合、1例FGFR2-INA融合、1例FGFR4-RAPGEFL1融合和1例FGFR1与SLC20A2 5'-非翻译区的融合(可能导致FGFR1过表达)。值得注意的是,6例患者同时检测到EGFR突变或扩增,其中4例接受过EGFR-TKIs治疗,且在NGS检测前均发生疾病进展,表明FGFR融合可能是EGFR-TKI继发耐药机制之一。此外,24例患者检测到FGFR扩增突变,且FGFR1扩增发生率最高。



结论


超万例样本NGS检测,回顾性分析了中国NSCLC患者FGFR突变的发生率和突变特征。结合临床治疗史发现,4例接受过EGFR-TKIs治疗的患者在NGS检测前均发生疾病进展,表明FGFR融合可能是EGFR-TKI继发耐药机制之一。

通过大样本NGS检测,结合临床特征和治疗史,全面分析肿瘤患者基因突变发生率和突变特征,可以为肿瘤精准治疗提供更多的临床证据。世和基因已累计检测超31万例中国人肿瘤样本,并建立特殊病例治疗跟踪机制,为“罕见”突变的治疗积累了大量的临床研究数据。世和基因期待与更多专家合作,共同着力推动精准医疗的快速发展。


Turning Science into Lifesaving Care. 

——AACR 2020

作者:留条鱼    审核:胖胖的鹏    美编:书桓

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