meme analysis

• 准备文件：物种的染色体序列文件和参考基因组注释文件

        Stuberosum_448_v4.03.fa

        Stuberosum_448_v4.03.gene.gff3

• 运行脚本，提取基因上游2kb序列，修改对应参数，得到。promoter.fa文件

• 用meme软件运行

• meme promoter.rename.fa -dna -oc ./ -nostatus -time 18000 -maxsize 6000000 -mod anr -nmotifs 10 -minw 6 -maxw 100