核糖核酸外切酶

概要

RNA分别透过水解（左方）和磷酸解（右方）的3'端解解反应简图。

核糖核酸外切酶（Exoribonucleases）是核糖核酸（RNA）的外切酶，是一种能降解RNA，并在5'端或3'端的核苷酸移除的酶。能移除5'端核苷酸的这种酶称作“5'-3'核糖核酸外切酶”，而能移除3'端的则称作“3'-5'核糖核酸外切酶”。

此类酶有两种机理，分别是以水（水解活性）或以无机磷酸盐（磷酸解活性）去破坏RNA上的核苷酸-核苷酸键。水解核糖核酸外切酶分类在EC3.1中，因以水去降解RNA，因此生成单磷酸核苷；而以无机磷酸盐降解的则因有外在磷酸盐加在生成分子上，因此形成二磷酸核苷。

核糖核酸外切酶存在于所有生命的界别中，包括细菌、古菌及所有真核生物。能对不同类别的RNA种类作用，包括信使RNA、tRNA、核糖体RNA及微RNA。核糖核酸外切酶可简单如单个蛋白质分子的（如核糖核酸酶D和核糖核酸酶PH），亦可以复杂至包含多个蛋白质分子的外切体复合物（当中包括核糖核酸外切酶的四个家族）。

主要家族

家族	成员例子	分布	催化活性
RNR	核糖核酸酶R	部分细菌及所有真核生物	3'-5'水解
	核糖核酸酶II
	Rrp44
DEDD	核糖核酸酶D	部分细菌及所有真核生物	3'-5'水解
	核糖核酸酶T
	PM/Scl-100
	寡核苷酸酶
RBN	RNase BN	部分细茵	3'-5'水解
PDX	PNPase	所有界	3'-5'磷酸解
	PM/Scl-75
	核糖核酸酶PH
RRP4	Rrp4	所有真核生物及大部分古菌	3'-5'水解
5PX	核糖核酸外切酶I	所有真核生物	5'-3'水解
	核糖核酸外切酶II

参考文献

• Zuo Y, Deutscher MP. Exoribonuclease superfamilies: structural analysis and phylogenetic distribution. Nucleic Acids Res. 2001, 29 (5): 1017–26. PMC 56904. PMID 11222749. doi:10.1093/nar/29.5.1017.

外部链接

• MeSH（医学主题词）上面的Exoribonucleases（美式英语）

参见

• 核酸酶（Nuclease）
• 核糖核酸酶（Ribonuclease）
  • 核糖核酸内切酶（Endoribonuclease）
• 去氧核糖核酸酶（Deoxyribonuclease）
  • 去氧核糖核酸外切酶（Exodeoxyribonuclease）
  • 去氧核糖核酸内切酶（Endodeoxyribonuclease）
• 外切酶（exonucleases）

3.1.6：硫酸酯酶类

芳基硫酸酯酶（芳基硫酸酯酶A、芳基硫酸酯酶B、芳基硫酸酯酶E、类固醇硫酸酯酶） · 氨基半乳糖-6硫酸酯酶 · 艾杜糖醛酸-2-硫酸酯酶 · N-乙酰氨基葡萄糖-6-硫酸酯酶

核酸酶（包含
脱氧核糖核酸酶
及核糖核酸酶）

3.1.11-3.1.16：外切酶	脱氧核糖核酸外切酶 RecBCD 核糖核酸外切酶 寡核苷酸酶
3.1.21-3.1.31：内切酶	脱氧核糖核酸内切酶 脱氧核糖核酸内切酶Ⅰ · 脱氧核糖核酸内切酶Ⅱ · 脱氧核糖核酸内切酶Ⅳ · 限制性内切酶 · UvrABC核酸内切酶 核糖核酸内切酶 RNaseⅢ · RNase H（1、2A、2B、2C） · RNase P · RNase A （1、2、3、4/5） · RNase T1 · RNA诱导沉默复合体 作用于脱氧核糖核酸或核糖核酸 曲霉属核酸酶S1 · 微球菌核酸酶

EC 1.1/2/3/4/5/6/7/8/9/10/11/12/13/14/15/16/17/18/19/20/21/22 · 2.1/2/3/4/5/6/7(2.7.10/11-12)/8/9 · 3.1/2/3/4(3.4.21/22/23/24)/5/6/7/8/9/10/11/12/13 ·

4.1/2/3/4/5/6 · 5.1/2/3/4/5/99 · 6.1-3（英语：Template:Ligases CO CS and CN）/4/5-6

2.7.6（英语：List of EC numbers (EC 2)#EC_2.7.6:_Diphosphotransferases）：二磷酸转移酶类（英语：Diphosphotransferase）
(P₂O₇)

• 核糖磷酸二磷酸激酶（英语：Ribose-phosphate diphosphokinase）
• 硫胺素二磷酸激酶（英语：Thiamine diphosphokinase）

2.7.7：核苷酸基转移酶

聚合酶	DNA聚合酶 DNA指导的DNA聚合酶 DNA聚合酶Ⅰ DNA聚合酶Ⅱ（英语：DNA polymerase II） DNA聚合酶Ⅲ全酶 DNA聚合酶Ⅳ（英语：DNA polymerase IV） DNA聚合酶Ⅴ（英语：DNA polymerase V） RNA指导的DNA聚合酶 逆转录酶 端粒酶 DNA核苷酸基外转移酶/末端脱氧核苷酸转移酶 RNA核苷酸转移酶 DNA指导的RNA聚合酶RNA聚合酶 RNA聚合酶Ⅰ（英语：RNA polymerase I） RNA聚合酶Ⅱ RNA聚合酶III RNA聚合酶Ⅳ（英语：RNA polymerase IV） RNA聚合酶V 引发酶 RNA指导的RNA聚合酶RNA复制酶
磷酸解作用 由3'端至5'端的核糖核酸外切酶RNA酶PH PNPase（英语：Polynucleotide phosphorylase）
尿苷酰转移酶	葡萄糖-1-磷酸尿苷酰基转移酶 半乳糖-1-磷酸尿苷酰基转移酶
鸟苷酰转移酶	mRNA加帽酶
其它	重组酶（整合酶） 转座酶

2.7.8：杂项

磷脂酰基转移酶类	CDP-甘油二酯—甘油-3-磷酸3-磷脂酰基转移酶 CDP-甘油二酯—丝氨酸O-磷脂酰基转移酶 CDP-甘油二酯—肌醇3-磷脂酰基转移酶 CDP-甘油二酯—胆碱O-磷脂酰基转移酶
糖基-1-磷酸转移酶类	N-乙酰葡糖胺-1-磷酸转移酶

2.7.10-2.7.13：蛋白激酶类
（PO₄；蛋白质受体）

2.7.10：蛋白酪氨酸	见酪氨酸激酶类
2.7.11：蛋白丝氨酸/苏氨酸	见丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶类
2.7.12：蛋白双特异性	见丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶类
2.7.13：蛋白组氨酸	蛋白组氨酸前激酶 蛋白组氨酸远激酶 组氨酸激酶

EC 1.1/2/3/4/5/6/7/8/9/10/11/12/13/14/15/16/17/18/19/20/21/22 · 2.1/2/3/4/5/6/7(2.7.10/11-12)/8/9 · 3.1/2/3/4(3.4.21/22/23/24)/5/6/7/8/9/10/11/12/13 ·

4.1/2/3/4/5/6 · 5.1/2/3/4/5/99 · 6.1-3（英语：Template:Ligases CO CS and CN）/4/5-6