如何理解搞懂codon，cds，mRNA，sense strand，ATG，AUG之间的关系

今天查看密码子表格时发现起始密码子是AUG，但我经常看到的cds序列起始密码子是ATG，这两个哪种正确呢？感觉时间太久了，有些概念记不清了，今天来总结复习一下codon，cds，mRNA之间的关联。

要了解codon，cds，mRNA，sense strand，ATG，AUG之间的关系，要先了解DNA组成链和转录的关系

DNA组成链和转录的关系

DNA组成链.jpg

如图所示，DNA一般共有2条链，被称为双链DNA(dsDNA)。转录时DNA的1条链被选为转录模版，这条链被称为转录链，模版链，非编码链或者反义链，英文名称是 antisense strand。反义链转录为mRNA，进行下一步的翻译。mRNA中含有密码子(codon)。

另一条没有被转录的链被称为正义链，编码链，非转录链，非模版链，英文名称是sense strand。这条链和mRNA的碱基序列一致，区别就是，mRNA中没有T(胸腺嘧啶)，只有U(尿嘧啶)。这也是密码子中ATG或者AUG都可以翻译成甲硫胺酸的原因。正义链中也具有密码子。

为了更便于理解正义链和反义链的区别，总结两者主要区别如下：

正义链和反义链的区别

1.正义链是编码链，而反义链是非编码链。
2.正义链类似于RNA，只是DNA中的胸腺嘧啶对应RNA中的尿嘧啶，其他碱基保持一致。另一方面，反义链充当RNA合成的模板。
3.正义链具有密码子，反义链中没有密码子。
4.正义链将不具有mRNA的相关序列，反义链却具有。

到这里我们知道了mRNA是和DNA正义链序列一致的，只不过mRNA里面没有T，替换为了U。

接下来了解CDS序列，需要先知道DNA的分区以及具体转录过程。

DNA的分区以及具体转录过程

DNA分区及具体转录过程

DNA可以分为编码区和非编码区。编码区由外显子和内含子组成。DNA的编码区经过转录，生成了hNRNA，也称为不均一核RNA。hnRNA又分为外显子转录区域和内含子转录区域，经过剪切这一步，内含子转录区域被删掉，只剩下内含子转录区域被拼接到一起，星辰了mRNA。mRNA又分为cds，一段编码蛋白质的序列，以及UTR，即非翻译区，不能编码蛋白质的序列。

总结来说，NCBI中的cds序列就是mRNA序列中的可编码区域，只不过为了保证数据的统一性，为了下游的方便分析处理，mRNA的序列还是用T来表示U。所以密码子表中的AUG没有错，cds序列中的ATG也没有错。