这篇文章题目:ZNF154 is a promising diagnosis biomarker and predicts biochemical recurrence in prostate cancer 文章来源:https://www.ncbi.nlm./pubmed/?term=ZNF154+is+a+promising+diagnosis+biomarker+and+predicts+biochemical+recurrence+in+prostate+cancer 发文套路: 1、从TCGA和GEO上下载甲基化数据和RNAseq数据 2、对甲基化数据做差异分析,筛选出有差异的基因 3、在众多的基因中,发现ZNF154最值得后续分析 4、拿ZNF154到Oncomine中验证,发现也是有差异的 5、甲基化位点与mRNA的表达水平相关性分析 6、对ZNF154做共表达分析,对前100个共表达基因做功能分析 7、收集病人样本,进行定量PCR,发现ZNF154也是有差异的 8、绘制ROC曲线,确定诊断价值 9、ZNF154甲基化与临床性状的相关性分析 11、进行Cox回归分析 11、进行生存分析,确定各位点甲基化水平预后价值 最终,发现ZNF154能够作为诊断前列腺癌生物标志物,并且能够预测复发 |
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