肺纤维化，临床有很多种类型，原因未明的称之为特发性肺纤维化，为纤维化性间质性肺炎，这类疾病多数呈慢性进展性，临床表现为渐进性加重的活动性呼吸困难，常伴干咳。90%的病人可在双肺基底部闻及吸气末细小的Velcro啰音。肺功能不断下降，平均生存期较短，据医学院校的教科书《内科学》认为，诊断后中位生存期为2-3年，但个体差异较大。
抗纤维化药物毗非尼酮和尼达尼布对本病有一定效果，但认为最有效的治疗方法是肺移植，可是肺移植的相关问题很多，包括严重的排斥反应、需要长期服抗排斥药，并发严重的感染等等。所以，只有60%左右的肺移植病人能够活过五年。
如果肺纤维化能找到原因，比如结缔组织病引起的肺纤维化，是由于间质性肺炎治疗不及时，或对治疗反应差，才展为肺纤维化。
而新冠病毒肺炎，也是表现为间质性肺炎，治疗好转后，炎症如果完全消失，不留痕迹，那么就不会发展为严重的肺纤维化。但如果炎症吸收不完全，可能会留下肺纤维化的后遗症。
由于发展为肺纤维化后，治疗难度很大，所以早期诊断，早期用干细胞进行干预和治疗，是取得成功的关键。
近期有实验研究显示，小鼠发生肺纤维化的早期进行间充质干细胞移植治疗，可有效缓解炎症和抑制肺纤维化病程。认为，间充质干细胞产生的分泌物能够在体外抑制成纤维细胞的增殖，促进HGF介导的肺上皮损伤修复；间充质干细胞外泌体能够增强巨噬细胞的吞噬，减少中性粒细胞的过氧化酶，抑制T细胞增殖，从而减轻肺纤维化小鼠的肺部炎症，改善肺泡衰竭和减少纤维化。
据现有的数据显示，在纤维化肺疾病的早期、炎症活跃期进行间充质干细胞移植具有较好的治疗效果，而对已经形成的肺纤维化要取得明显交果是非常困难的。
Glassberg等招募9名轻度至中度特发性肺纤维化患者进行不同剂量的单次异体骨髓间充质干细胞移植治疗，移植治疗60周后，患者的肺活量、一氧化碳扩散能力相比预测值略低，有抑制疾病进程的作用。
Chambers等用胎盘来源治疗特发性肺纤维化，6个月后患者的肺功能指标、6分钟行走距离、CT纤维化分数等都与治疗前相当，病情没有进一步恶化。
Zhang等报道了一例利用脐带间充质干细胞静脉回输治疗特发性肺纤维化的案例。患者56岁，需要长期氧疗；移植12个月后，患者对长期氧疗的需求降低，患者的身体性能、生活质量和呼吸参数等都有所改善，表明脐带间充质干细胞移植对肺纤维化患者是有益的，可作为额外的治疗方案。
我们曾对结缔组病合并的间质性肺炎，采用围产期组织来源的间充质干细胞治疗，发现在早期的浸润性病灶效果良好，可以阻止其发展为晚期的肺纤维化。
对新冠病毒肺炎，现有的临床应用结果已经显示出良好的效果，尤其在挽救危重型病例的抢救过程中，发挥了很大的作用。其机制是多方面的，包括干细胞通过与靶细胞直接接触、旁分泌效应，调节免疫功能，抑制炎症反应，减少肺泡上皮细胞死亡，促进肺组织的修复。
但目前还没有直接证据说明间充质干细胞分化成肺泡细胞，即使发生了分化过程，但在人体中得以证实是非常困难的。
有学者采用单细胞基因测序，发现，治疗新冠病毒肺炎的间充质干细胞高度表达抗炎因子和营养因子，高度表达二种肺表面活性物质蛋白（SPA和SPC），推测间充质干细胞极有可能分化成肺部AT2细胞（2-型肺泡细胞）。
