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强烈推荐!大型医学公共数据库大盘点

 国熙台 2021-01-19

本文作者杨其霖,第七期小黑屋学员,学号:BH70256,广医二院重症医学科医生,众多小黑屋训练营学友的新晋男神~

输12

为什么要挖掘公共数据库???


每次想到这句话就有为何不吃肉糜的感觉。

数据矿主确实很难理解临床医生之忧伤。我们就是一个普普通通的临床医生,没有课题,没有经费,没有数据。这个时候做不了临床研究吗?

当我们沉下心,花上几个月时间,终于,研究设计,手到擒拿;回归拟合,信手拈来;研究注册,轻而易举。屠龙之术学会了,龙还没有找到,为之奈何?

这时候你会发现临床科学家世界的美好。临床科学家们公开了大量的临床研究数据,大家完全可以拿来就用。最开始,完全可以把原文的图表模仿几遍,SPSS,STATA,R,GraphPad。反复琢磨,文章的套路就变成自己的了。如果可以提出不同的研究假设,那可能将会是一项高质量临床研究和论文的起点。

那么常见的医学公开数据有哪些呢

今天小编给大家做个小小的总结

后期还会有专题详细介绍~

1.MIMIC重症系列

  • 包括MIMIC-II,MIMIC-III,MIMIC-IV, eICU,PIC(儿科),HIRID数据库。其中使用较多的是MIMIC-III数据库。该数据库可以免费申请使用,内有贝斯以色列女执事医疗中心在2001年和2012年之间重症监护室超过四万病人的相关数据。数据库包含信息如人口统计学特征、床边生命体征的测量,实验室测试结果,各种操作、药物、影像报告和死亡指标。 

  • 网址:https://mimic./

2.美国NHANES数据库

  • 美国人群营养横断面调查数据库。美国健康和营养调查(NHANES)是一个旨在评估美国成人和儿童的健康和营养状况的调查研究。这项研究的独特之处在于,它结合了调查和身体检查。NHANES调查包括人口统计特征、社会经济、饮食和健康相关的问题。检查组件包括医疗、口腔科和生理测量,以及实验室检测。从这个调查结果将用于确定重大疾病的患病率和疾病的危险因素。

  • 网址:https://www./nchs/nhanes/


3.中国CHNS数据库

  • 中国健康与营养调查(China Health and Nutrition Survey ,简称CHNS)是由美国北卡罗来纳大学人口中心与中国预防科学医学院联合进行的大规模的社会健康调查。调查的内容涉及诸多方面,包括健康学、营养学、社会学、人口学、经济学、公共政策等多个学科,数据内容包括社区调查、家庭户调查、个人调查、健康调查、营养和体质测验、食品市场调查及健康和计划生育调查。

  • 网址:https://www.cpc./projects/china


4.韩国KNHANES数据库

  • 韩国人群营养调查数据库,确定了韩国人群健康和营养状况的现状和趋势,数据有人口统计学特征,家庭调查,吸烟,酗酒,肥胖和体重控制,体育锻炼,发病率,医疗用途,疫苗接种和健康检查,活动限制和生活质量,损害(意外和成瘾),安全意识,心理健康,妇女健康,教育经济活动,口腔健康,食物和营养摄入状况,饮食行为,膳食补充剂,营养知识,食物稳定性,泌乳状况,补充饮食。

  • 网址:https://knhanes.cdc./knhanes/main.do


5.美国SEER 肿瘤数据库

  • SEER肿瘤数据库是由美国国立癌症研究所(National Cancer Institute,NCI)建立,是北美最具代表性的大型肿瘤登记注册数据库之一,收集了大量医学的相关原始数据。数据库中的肿瘤可分为9类:乳腺、结肠&直肠、其他消化系统、女性生殖、淋巴&白血病、男性生殖、呼吸系统、泌尿系统及其它尚未确定的类型。临床数据记录中包括患者的注册编号、人口统计学特征、肿瘤特征、治疗方案、死亡原因等信息。

  • 网址:https://seer./

6.BioLINCC数据平台

  • 生物标本和数据采集信息中心(Biologic Specimen and Data Repositories Information CoordinatingCenter),是2008年由NHLBI建立的数据库。BioLINCC数据库包含两类数据,一是NHBLI生物标本数据,这类数据自1975年开始由血液疾病部门(Division of Blood resources)管理,一类是NHBLI数据。

  • NHBLI临床研究数据主要来源于最近70多年以来的流行病学研究和临床研究,包含来自于145家中心临床注册研究和观察性研究的数十万患者数据。临床注册研究的数据包含患者基线资料、中期随访信息、辅助研究以及预后资料(包含实验室检查);流行病学研究数据包含在整个观察周期内获得的所有监测结果。

  • 网址:https://biolincc.nhlbi./home/


7.全球卫生数据--GHDX

  • 全球卫生数据(GHDx)是一个全球卫生和人口数据的目录。GHDx的目标是帮助人们找到数据编目数据信息包括主题,通过提供链接数据提供者或解释如何获取数据,并且在我们允许的情况下,提供的数据直接下载。GHDx研究包括人口普查数据,调查、注册、指标和估计,行政健康数据和与健康有关财务数据。

  • 网址:http://ghdx./


8.国家人口健康科学数据中心

  • 国家人口健康科学数据中心(简称NCMI)是国家科技部和财政部认定20个的国家科学数据中心之一,集成涉及基础医学、临床医学、药学、公共卫生、中医药学、人口与生殖健康等多方面的科学数据资源,还建立了16项特色专题服务,如农村三级医疗卫生专题服务、国民体质与健康专题服务、面向国际肿瘤转化医学专题服务、热点传染病预警与追踪专题服务等。

  • 网址:https://www./


9.Dryad公开数据平台

  • Dryad数据库受美国国家科学基金会资助,于2008年9月成立,是一家非营利性会员制组织。Dryad数据库中储存医学、生物学、生态学领域的研究数据,向全球开放,可免费下载其中的数据资源并可再次使用。

  • 网址 https:///stash


10.Figshare公开数据平台

  • 类似Dryad 的开放数据存储网站 

  • 网址:https:///

11.Zenodo数据平台

  • 类似Dryad 的开放数据存储网站 

  • 网址:https:///

总结的这些数据库数据量庞大、数据质量高,每个数据库都是一份巨大的宝藏,处处都值得去挖掘、去发现

这些数据库只要按步骤,step by step,均能免费获取,这些宝藏将都属于你,但也正因为每个数据库都含金量满满,新手的我们还是先专注其中一个数据库,由小及大、由浅及深,真正吃透每个数据库

公开数据库挖掘,从此刻开始,后期更有各数据库的专题详细介绍,敬请期待~~


END

作者 | 杨其霖

审核| 念荣 Alie

编辑| 小秋

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