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可能很多拿到我中通量SNP测试数据的人会有疑问，说原本说的结果是O3，为什么中通量的细分结果却是用O2打头的？这个需要解释一下，不是哪个做错了，而是用的支系命名标准不一致。大家都知道，O下面会分O1, O2, O3这样，O2下面又有O2a和O2b，更有O2a1a1a...这样一级级细分下去的支系名称，总归名称是以一个大写拉丁字母开头，后面用数字和小写拉丁字母相间表示细的分类。 但分子人类学对分类的精度每年都在细化。比如O下面原先分的三支是O1-M119，O2-M268和O3-M122三支，一开始（到2013年之前）都只知道这三支都是在O-M175下面的，且这三支互不统属（即为平行关系），但并不清楚这三类里面哪两个相对更近一些。直到2012年，我们发现了F75位点（同时发现的有4000多个新位点），注意到原本属O1和O2的样本在这个位点上都有突变，而O3在F75没有突变，于是我们知道了O1和O2是有一个共同祖先的，而O3不在此下。那么按照命名原则，原来的O1和O2合并成为新的O1，原先的O1改为其下的O1a，原先的O2改为O1b，而原先的O3改为O2。如下图： 也就是说，在讨论O1、O2这样的用语时，必须明确是哪个版本的树，或者更通用的是，总是注明所用的定义位点，比如说O2-M268，还是O2-M122，这样就不会混了。最后，给一下几个常见版本的相互之间的对照关系。其中有一些带括号的是支系定名错误，就是上下游或平行关系错了。其它的都只是细化的问题。 为了和大多数市面上的科普读物的命名一致，以便新接触分子人类学的朋友不致过多困扰，通过Y-STR的结果猜测的支系或低通量的Y-SNP结果我们还是按2011年前的版本给的，也就是O1-M119, O2-M268, O3-M122这样。但中高通量数据因为新加的位点太多，不可能与之前的命名兼容了，只好用最新的命名（尽管这套命名还没有正式发表），就是O1a-M119, O1b-M268, O2-M122这样的了。 polyhedron 首发于新浪微博 2014.12.30 |
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