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原 Cell :使用高通量液滴测序对单个细胞进行高度平行的全基因组表达谱分析

 silenceboy3hdn 2021-02-27

第一章单细胞科研:第二节,单细胞技术介绍

##文章亮点


###  1 Drop-seq可通过RNA-seq高度并行地分析单个细胞

### 2Drop-seq与DNA条形码的珠子一起将细胞包裹在纳升的液滴中·

###3 使用物种混合实验对Drop-seq文库质量进行系统评估·

###4 通过对44,808个细胞的跌落序列分析,可以识别视网膜中的39个细胞群

1 #### 文章导读


        ###1细胞是生物学结构和功能的基本单位,其类型和状态差异很大。单细胞基因组学可以表征细胞的身份和功能,但难易程度和规模限制了其广泛应用。在这里,我们描述了Drop-seq,它是一种通过将成千上万的单个细胞分离成纳升大小的水性液滴,将不同的条形码与每个细胞的RNA关联并一起进行测序来快速分析其性能的策略。Drop-seq同时分析成千上万个单个细胞的mRNA转录本,同时记住转录本的起源细胞。我们分析了转录组从44,808个小鼠视网膜细胞中分离出39种转录不同的细胞群体,从而为已知的视网膜细胞类型和新型候选细胞亚型创建了基因表达的分子图谱。Drop-seq通过以单细胞分辨率进行常规转录谱分析,将加速生物学发现。

2 ### 单细胞高通量液滴测序计数原理介绍


 单细胞高通量液滴测序过程

2.1### 单细胞测序液滴测序视频介绍


访问https://www./science/article/pii/S0092867415005498?via%3Dihub


3####单细胞转录组制备过程和转录组


单细胞转录组制备过程和转录组


                        -----在读博士,代谢,组学研究 王平写作欢迎转发,精彩不断,学习不断。

4 #### 参考文献


                Macosko EZ, Basu A, Satija R, Nemesh J, Shekhar K, Goldman M, Tirosh I, Bialas AR, Kamitaki N, Martersteck EM, Trombetta JJ, Weitz DA, Sanes JR, Shalek AK, Regev A, McCarroll SA. Highly Parallel Genome-wide Expression Profiling of Individual Cells Using Nanoliter Droplets. Cell. 2015 May 21;161(5):1202-1214. doi: 10.1016/j.cell.2015.05.002. PMID: 26000488; PMCID: PMC4481139.

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