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理性思考是人类认识自然事物和社会事物的根本方法。理性主义和实证主义相结合是近代哲学与自然科学的基础。 什么是实证主义?实证主义可以归结为一句话，那就眼见为实。为了获得自然事物的确切知识，我们就需要毫无偏见的观察它。观察事物并从中引导确切的知识，这便导致了以实验为基础的科学研究方法。这个方法是一切自然科学的基础。 什么是理性主义?自然事物客观存在的秩序具有理性美这一特性同样是一件令人惊奇的事情，我们只能承认它，而不能理解它何以如此。存在的秩序是有规律的，而且这个规律本身符合人类思想的逻辑规律。我们可以通过经验感知事物及其存在，但却不能直接感知事物存在秩序的逻辑之美。事物存在背后的规律则需要人类的思想去领悟。所以只有经验而没有理性是没有学术和思想而言的。人类的理性通过主观构造种种逻辑系统用以模拟事物客观存在背后的秩序，这就是科学理论或哲学学说。 如何保证通过理性构造的逻辑模型(即理论或假说)正是存在背后的客观规律呢?这就需要我的从这个模型中推导出可以被实验验证结论来。人类的感觉和知觉是用来体验物质及其存在的，而人类的大脑和思维则是用来领悟事物存在秩序的理性之美的。存在的秩序(即规律)不能直接成为感知觉的对象，规律只能通过理性思维去体悟和构造。人类思想主观上可以构造无限多个有关存在秩序的逻辑模型，但却不能够通过自身纯逻辑的确保其为真。为了探索存在秩序背后的真理，我们就需要让它接受实验的检验。所以，理性主义与实证主义相合的认识方法是由自然事物内在属性所决定的。 自然事物的存在及其存在秩序的合理性都是人类只能接受而无法确切理解的基本事实，造物主赋予我们感觉和知觉官能用以感知存在及实在，又赋予我们思想以领悟存在秩序的合理性，这同样又是无法确切理解的基本事实。既然有思想我们必然就要去理解，人类文明就是人类思想导致的现象。动物只能感知存在却不能理解规律，这是人与动物最根本的区别。 在自然科学大发展以前，人类就只能通过纯哲学思辨的方式来理解和阐释存在及其秩序，这就是哲学学说。近代自然科学则是实证主义的方法引入哲学领域的产物，从而使得人类获得有关事物存在及其规律的更确切的知识。自然科学的实质就是理性主义与实证主义相结合的方法在具体事物研究中的运用。自然科学的知识都是在以实验观察为基础，理性逻辑辨的不断创造新理论并验证新理论的过程中产生的，这方法本身已经保证了这些知识体系的真理性。科学研究方法在不同领域中的运用，便产生了科学知识的不同学科。比如，物理学，化学，植物学，动物学，人类学，社会学，历史学，生理学，解剖学，医学等。 在近现代东西文明碰撞以前，我国传统文化的知识体系尚停留在哲学与自然哲学的阶段，与近代文艺复兴以前的西方世界相同。我国文化传统中并未发展出理性与实证相结合的研究自然事物的科学方法，在这个意义上，我国传统文化中并没有属于自然科学的知识体系。我们若要使我们的传统文化注入新的活力，我们需要引入科学的研究方法而不是排斥它。有人说，假如中医学引入科学研究的方法，就会导致中医学的灭亡，但要知道我们如果不引入科学研究的方法去研究它而不思变革，它迟早也会被现代医学所淘汰掉。 在理性思考的原则下，无论是《易经》，还是《道德经》都没有什么神秘性可言，卦理不神秘，道也不神秘，那些不过是古代先哲的学术作品，在本质上与柏拉图、亚里士多德的著作没有什么区别。要说区别也不过是探讨的具体问题不同与所涉及的领域不同而已。严格来说《易经》的内容不属于哲学知识的范畴，但它的产生、应用、原理都是可以理解的，没深奥神秘可言。老子的学说虽然属于哲学范畴，但它主要讨论是政治与社会的问题，并未涉及存在或物理的范畴。 属于自然哲学知识范畴的内容只在《内经》的知识中找到，而且我们也不能过分迷信它，它也只不过是一个假说，代表古人对事物理解的一定阶段。任何试图从中找寻终极原理的企图都将是徒劳的。中国文化的发展在未来，是在我们将传统文化的知识体系融入到自然科学的知识体系中之后。忽视科学的研究方法，仅凭祖宗遗产而不思变革是不会有前途的。所以，我们研究国学也一定要坚持理性思考。
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