目录一. Perseus二. 文章描述三.Perseus 下载四 .数据预处理1.所用数据2 .打开软件页面3. 上传数据 点击左上角的绿色箭头4.选择文件5. 预处理1)数据过滤过滤污染蛋白过虑unique peptide >1搜库时加了反库,可以过滤掉反库,本章没有提到2)数据转换:Basic-> transform3)缺失值替换五 .本期作业 一. Perseus作为MaxQuant的后续分析工具 丰富的可视化功能与统计分析功能 –聚类分析 –差异蛋白筛选 –时序数据分析 –网络分析 二. 文章描述大家从第七期的流程中获得了Maxquant 输出的结果,接下来进行数据分析。 文章数据预处理流程
三.Perseus 下载网址https://www./perseus/ 四 .数据预处理这次教程我们先针对 OVCA429 细胞的输出数据进行预处理.。结果数据放在微云链接,大家自行下载。 1.所用数据2 .打开软件页面3. 上传数据点击左上角的绿色箭头4.选择文件选择要用的列 5. 预处理1)数据过滤过滤污染蛋白过虑unique peptide >1搜库时加了反库,可以过滤掉反库,本章没有提到2)数据转换Basic-> transform3)缺失值替换五 .本期作业把OVISE 细胞的6个文件输出的 proteinGroup 数据按照上面方法进行预处理。数据放在微云连接。大家自行下载,不用再次跑Maxquant搜库。 |
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