生物信息学生R入门教程关于生信,网上的学习资料有很多,初入门的学生,往往迷失在纷繁复杂的教程中,而找不到发力的方向。那么有没有一些整理的比较系统的总结呢,答案是有的。今天我们要给大家分享的就是一个比较系统的入门书籍。它系统的介绍了各组学的分析流程,并且是中文书写,阅读完全无压力。下面我们具体来看看这本书吧。
原文链接 https:///new/book/ 书籍目录:
作为一本入门书籍,它比较系统的介绍了五个组学的分析流程。能使初学者对这些组学有一个清晰的、直观的、系统的印象。 关于单细胞转录组对于单细胞转录组学,这本书介绍了如何使用Seurat和Monocle来分析scRNA-seq数据。 下面我们来看一下大概涉及哪些分析 Seurat基本分析流程
Monocle基本分析流程
小结以作者看来,分析scRNA-seq的数据的关键在于如何对细胞进行cluster。这其中有很多的算法,而之后的降维分析比如tSNE其实主要还是为了数据图形化显示方便。在细胞分群之后,差异表达分析其实与第三章的RNA-seq并无二致,我们只需要对需要比较的因素做到心中有数即可。 |
|