乳腺癌是单细胞领域文章最多的,列表如下: 而“2019年度技术”(Method of the Year 2019)选择了单细胞多组学,可以对单个细胞的基因组、转录组、蛋白质组、代谢组等生物学标志进行多维分析,这个分析难度更高。我们还在研发阶段,不过看到朋友圈有人分享一个单细胞病理水平的研究,发表在 Nature (20 January 2020),文章标题是:The single-cell pathology landscape of breast cancer. 该研究首先利用成像型质谱流式细胞仪同时对35种生物学标志进行量化,从而获得乳腺癌患者肿瘤组织的高维病理学图像,图像识别技术看里面的单细胞各种生物学标志物的测量值。 病人队列及取样We identified 855,668 cells in 381 images (289 tumour, 87 healthy breast and 5 liver controls), and quantified the expression of both marker genes and the spatial features of each cell. 171,288 subsampled 单细胞tSNE图乳腺癌恶性的上皮细胞和肿瘤微环境分开分析首先需要有生物学背景,知道细胞可以分成:
而且得到了规律之后,又纳入72个病人,采样344 additional images containing a total of 411,410 cells 验证。 |
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