写在前面《-零命令行-生信下游数据分析》的第一帖主题,定为序列提取。因为序列提取,可以说是目前最常见的生信下游数据分析需求,其主要见于场景: 1.物种基因组已公布,但没有对应的数据库,而我只是需要某个染色体的一个区段 2.手上有无参考转录组组装结果,需要从其中提取出一些我感兴趣的基因的序列,如某几个差异表达基因 场景有很多。而目的只有一个,即省时省事地得到我要的序列。本篇推文,可以让任何人在短时间内掌握并完成自己需要的序列提取,几乎没有学习成本。 准备数据
开始提取1.首先打开TBtools,并选择对应的工具Amazing Fasta Extractor 2.设置序列库文件
3. 提取序列 如果一次提取少量序列,只是快速使用,那么无需设置输出文件,直接勾选,使提取的序列显示在对话框,用于文本复制与黏贴
同样的方式 ,如果是要提取某个序列区段 4. 其他需求 或者,建议加入TBtools使用交流群- QQ群,与其他在科研工作中使用TBtools的朋友交流
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