总有人抱怨非肿瘤的纯生信难发,非肿瘤的分析没有多少内容可以做。总是感觉非肿瘤纯生信只能做差异分析、GO富集分析、KEGG富集分析、PPI分析、WGCNA分析,然后就没有然后了。其实,非肿瘤还是有很多东西可以做的,只是你们没有想到而已,具体详情可以参考我们下面这种套路: 01
数据下载处理、合并、矫正、差异分析 02 第二步 重点关注免疫分析部分,不做其他分析,CIBERSORT这种算法估计审稿人都看腻了,我们使用ssGSEA算法计算免疫评分,并且分为免疫细胞和免疫功能这两部分 03 第三步 进行免疫细胞之间的相关性分析、免疫功能之间的相关性分析 04 第四步 进行正常组与疾病组之间免疫评分的差异分析 05 第5步 进行显著表达的基因与免疫细胞、免疫功能的相关性分析,并且筛选与免疫最为相关的基因(重点分析内容) 06 第六步 选出与免疫最为相关的基因构建模型(重点分析内容) 07 第七步 GO与KEGG分析估计审稿人都看腻了,我们来做一下DO分析 总结: 根据上面这7步分析就得到了一篇全新的非肿瘤纯生信SCI,这样就不用老是担心做以前的旧套路分析。非肿瘤一样可以创新,一样的可以成为第一个吃螃蟹的人。没有钱补实验,就只能拼内容创新,同时要拼选期刊的艺术。 |
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