【原】PubMed使用指南(三): 检索界面介绍

前面我们详细的介绍了 [[pubmed-使用指南#pubmed 关键词检索]] 以及 [[pubmed-使用指南#pubmed 高级检索]]。今天就来介绍 PubMed 检索结果页面都有哪些内容。这里我们还是以："mutation[Title/Abstract]" 的检索结果作为例子。

主检索界面

通过检索可以看到下面这样的内容。其中上面是操作栏，右边是筛选栏，中间则是具体的检索结果

检索界面

操作栏

在操作栏主要是对检索结果进行保存以及对检索结果展示的自定义。

结果保存

点击Save把检索结果的各个信息保存成离线文件。例如把每个文献的摘要保存下来。

save 检索结果

这样保存的文件可以进行额外的操作。比如进行分析文献内的文字进行一些文本挖掘，或者导入到 [[文献管理软件介绍]] 当中进行文件的管理。

除了可以下载成离线文件，也可以把这些结果直接发送到自己邮箱。

检索结果发送email

上面两个方法是把想要保存的文献直接保存在别的地方 PubMed 还可以Send To在线保存文献。比如保存到粘贴板 (Clipboard)，或者类似于 PebMed 在线文献库的 My Bibliography。

这里主要还是介绍一下粘贴板的用法，其他几个有兴趣的可以了解一下 PubMed 的操作指南。

Clipboard在一次性要收集很多方面的文献的时候非常有用。比如在收集Mutation 和 Methylation两个方面的文献，
其中在 Mutation 当中发现前俩文献有用，就可以选择前俩文献然后点击Send——Clipboard

保存之后，可以在检索栏下面有了一个Clipboard (文献个数) 的按钮。

继续检索Methylation[TIAB]。也选择前两个文献保存到 Clipboard 当中。

这样中意的文献就都保存到 Clipboard 中了。点击Clipboard可以看到之前选择的文献。

Clipboard界面

对于这些保存的文献，可以一起进行Save或者Email操作。避免了重复操作了。

最后需要注意的是，Clipboard 里面的内容只能保存8 个小时。如果想要保存更久，可以放到 My Bibliography 当中。

结果展示自定义

默认的 PubMed 检索结果是基于"Best match"算法进行排序的。且按照"Summary"的格式在每页展示 20 个参考文献。

文献默认展示界面

上述的排序类型，文献格式以及每页展示多少个文献都可以自定义。

文献自定义展示

筛选栏

PubMed 的结果界面可以看到检索的文献的每年发表数量汇总，也可以看到关于文献类型，发表日期，文献内容等方面的筛选选项。

筛选栏总概

其中筛选的内容，可以在Additional filters选择自己常用的一些筛选选项。

添加筛选内容

以上官方给的一些常用的筛选项，如果有自己自己感兴趣的一些筛选项还可以自己来制定。比如检索结果和基因有关的文献，或者有 GEO 数据的文献。

至于如何制定自定义筛选项目，可以改天再聊。

自定义筛选内容

文献具体界面

在检索结果界面，点击每个文献的标题可以看到这个文献的具体内容。

文献具体信息

大多数的情况下，可能也就只是看一看摘要就过去了。但是在结果界面还包括很多其他的内容。

其中Similar articles当中可以查看和这个文献相似的其他文献。这个对于寻找某一类的文章特别的方便。

另外也是可以通过：[[connectedpapers-文章相似性分析]] 来进行分析。

相似性文献查找

而Related information则可以查看这个文献中的新和其他数据库的关系。例如检索的这个文献就是提到了 GEO 的高通量数据。直接点击就可以找到这个文献的 GEO 数据。

其他数据库链接