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GENE ONTOLOGY-基因本体功能查询数据库。所以今天就来了解一下鼎鼎大名的GO ONTOLOGY数据库：Gene Ontology Resource: http://geneontology.org/GO ONTOLOGY是一个基于已经发表的的研究结果，对基因功能进行注释的数据库。GO ONTOLOGY将物种中基因的功能分成了三个部分：分子功能 (Molecular Function, MF)；在GO ONTOLOGY中，可以直接输入想要... 阅188 转5 评0 公众公开 22-06-30 01:24 |
mqtldb-meQTL预测数据库。Pancan-meQTL: http://gong_lab.hzau.edu.cn/Pancan-meQTL/通过数据库的名称也可以发现，Pancan-meQTL属于在肿瘤当中分析meQTL的情况。#cis-QTL 与 trans-QTL]]的特征对以上分析分析数据，进一步分成了cis-meQTL以及trans-meQTL。最终就获得了cis-meQTL、 trans-meQTL、Survival-meQTL、GWAS-meQTLs四个功能。刚刚介绍... 阅118 转3 评0 公众公开 22-06-09 01:24 |
[原]如何关注自己的研究方向 如何关注自己的研究方向。作为一个科研人，每个人都会有自己的研究方向。在进行自己研究的同时，也要实时追踪根据自己研究方向有关的文献。所以今天就来给大家介绍几个用来追踪自己研究方向的方法。[[PubMed-使用指南]]提供了用来关注研究方向的方式。而RSS则可以实时获取研究内容的更新。而RSS，需要一个新的工具来接受订阅源的内容。 阅41 转2 评0 公众公开 22-05-10 01:21 |
基于文献元数据的分析：文献计量学（Bibliometric）通过网络分析可以了解，在这个领域哪些文献属于比较重要的文献（被引次数多的文献）以及文献之间的相似性（文献引用文献内容的相似性）。目前有很多一站式的文献计量学分析工具。「文献计量学」、「meta分析」以及「公共测序数据重分析」都是需要重新分析数据来获得新的结果。「文献计量学」... 阅83 转3 评0 公众公开 22-05-05 01:21 |
eccDNAdb｜肿瘤染色体外环状DNA数据库。染色体外环状DNA（eccDNA）属于线性的染色体DNA的一个扩展。之前对于eccDNA的基本特征，我们基于一个综述进行了简单的介绍: [[eccDNA基本内容]]。作者又使用了[[CCLE-肿瘤细胞系百科全书 v2.0-数据下载]]以及TCGA数据库对eccDNA-gene在肿瘤当中的特征进行了分析。另外，由于eccDNA上的基因并不是新产生的... 阅43 转1 评0 公众公开 22-04-21 01:21 |
CircleBase｜eccDNA综合性分析数据库。之前对于eccDNA的基本特征，我们基于一个综述进行了简单的介绍: [[eccDNA基本内容]]。而关于eccDNA相关的数据库，目前一共也才有两个在线数据库。CircleBase中的eccDNA主要来自于之前发表的eccDNA研究的测序数据。进一步，对注释到的基因进行了使用多个数据库进行了综合性的分析，其中包括调控的基因，转... 阅43 转1 评0 公众公开 22-04-20 01:33 |
[原]eccDNA基本内容介绍 eccDNA基本内容介绍。目前关于eccDNA的描述主要包括：eccDNA, Covalently closed circular DNA， Small polydisperse circular DNA (spcDNA)， microDNA, Telomeric circles, DMs, Episomes以及ecDNA。其中ecDNA是随着最近基因二代测序的研究，研究人员在肿瘤中发现了的巨型碱基对的eccDNA，进而也就命名为ecDNA。eccDNA的形成和维护eccDNA的形... 阅236 转0 评0 公众公开 22-04-19 01:21 |
SNiPA-SNP批量注释和检索数据库背景数据集介绍。SNP的注释以及SNP相关的QTL功能分析。其中SNP的注释主要来自于千人基因组计划，SNP的位置注释则收集了包括CADD, FANTOM5, StatBase在内的多个数据库；SNiPA提供了GWAS之前发现的SNP特征表型。Variant Annotation用来批量检测多个SNP的基本信息，类似于??具体一个SNP注释查看的批量操作。Block An... 阅159 转0 评0 公众公开 22-04-13 01:21 |
ADAtlas-老年痴呆网络分析数据库。所以今天就来介绍一个阿尔茨海默有关的综合性网络数据库：ADatlas: https://adatlas.org/背景数据集介绍。ADatlas的数据主要来自于一些关于AD的大规模测序数据 (基因组、转录组、蛋白质组以及代谢组学)。基于这些公共的测序数据来进行单一组学内的分析，比如转录组内部基因的相关分析；ADatlas主要是通过网络... 阅99 转0 评0 公众公开 22-04-12 01:24 |
2022.03在线数据库汇总。下面就来给大家介绍一下主要有哪些数据库，以及笔者比较感兴趣的数据库。关于基本信息的数据库，之前也介绍过一个[[ADEIP-年龄相关差异基因分析数据库]]。 阅67 转1 评0 公众公开 22-04-11 01:24 |
